More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2447 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  87.75 
 
 
204 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  67.54 
 
 
197 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  64.36 
 
 
191 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  61.7 
 
 
199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  62.23 
 
 
191 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  62.23 
 
 
191 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  62.77 
 
 
191 aa  225  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  56.52 
 
 
201 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  57.45 
 
 
203 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  51.63 
 
 
202 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  50.81 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  51.35 
 
 
199 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  49.69 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  48.35 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  45.41 
 
 
195 aa  171  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  49.17 
 
 
193 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  45.7 
 
 
206 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  45.16 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  48.07 
 
 
196 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  45.65 
 
 
196 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  44.81 
 
 
190 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  40.33 
 
 
197 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  45.36 
 
 
204 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  44.75 
 
 
199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  46.82 
 
 
194 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  42.08 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  42.62 
 
 
204 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  40.86 
 
 
203 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  39.89 
 
 
193 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  40.68 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  37.57 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  44.44 
 
 
191 aa  138  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  38.64 
 
 
194 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  43.02 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  38.38 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  42.47 
 
 
341 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  35.9 
 
 
212 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.85 
 
 
340 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  37.22 
 
 
186 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.5 
 
 
360 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  39.46 
 
 
327 aa  121  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  34.22 
 
 
205 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  39.56 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  38.59 
 
 
329 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  35.48 
 
 
337 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  40.54 
 
 
340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.8 
 
 
350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  40.86 
 
 
354 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 
341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 
341 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  35.91 
 
 
347 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  37.3 
 
 
340 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  35.56 
 
 
350 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.02 
 
 
385 aa  111  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  36.07 
 
 
359 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.78 
 
 
339 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  36.67 
 
 
338 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.84 
 
 
369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  36.11 
 
 
345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  36.41 
 
 
344 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  36.41 
 
 
342 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  34.22 
 
 
362 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.66 
 
 
353 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  36.81 
 
 
334 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.48 
 
 
384 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  35.56 
 
 
351 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  34.83 
 
 
258 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.71 
 
 
347 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.68 
 
 
369 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.57 
 
 
356 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  31.44 
 
 
344 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.38 
 
 
341 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  31.44 
 
 
344 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  35.56 
 
 
387 aa  104  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
364 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
364 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
364 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  36.52 
 
 
362 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
364 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  35.98 
 
 
341 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  34.62 
 
 
353 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
364 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
364 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.84 
 
 
344 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  35.96 
 
 
362 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1983  protein-glutamate methylesterase CheB  33.52 
 
 
390 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  41.4 
 
 
342 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  37.43 
 
 
385 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  35.39 
 
 
363 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  33.51 
 
 
356 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  35.39 
 
 
360 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.52 
 
 
340 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2103  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.87 
 
 
349 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262545  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  34.81 
 
 
364 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  34.83 
 
 
367 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  33.51 
 
 
350 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.85 
 
 
363 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  35.39 
 
 
360 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  35.39 
 
 
360 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>