More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2004 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  97.38 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  86.39 
 
 		 191 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  85.34 
 
 		 191 aa  321  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  62.77 
 
 		 197 aa  229  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  62.77 
 
 		 199 aa  227  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  61.17 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  62.23 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  59.04 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  55.98 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  54.1 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  51.93 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  51.38 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  50.55 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  45.16 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  48.09 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  47.85 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  47.8 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  49.72 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  48.35 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  45.36 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  44.94 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  47.25 
 
 		 196 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  47.03 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  48.26 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  46.52 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  45.99 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  40.88 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  42.86 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  39.25 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  38.5 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  46.63 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  40.32 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  48.33 
 
 		 191 aa  134  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  38.89 
 
 		 212 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  44.72 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  40.32 
 
 		 347 aa  121  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  41.67 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  40.12 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  41.76 
 
 		 342 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  41.11 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  39.44 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.78 
 
 		 385 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.56 
 
 		 347 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  40.11 
 
 		 350 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  38.38 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  37.63 
 
 		 345 aa  111  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  42.78 
 
 		 340 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.22 
 
 		 340 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.07 
 
 		 360 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40 
 
 		 350 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  39.78 
 
 		 354 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.83 
 
 		 352 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  38.98 
 
 		 334 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0943  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.51 
 
 		 354 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.53 
 
 		 341 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  39.23 
 
 		 387 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.04 
 
 		 356 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.55 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.53 
 
 		 341 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  39.34 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  37.1 
 
 		 344 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  43.68 
 
 		 341 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  37.1 
 
 		 329 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.56 
 
 		 1361 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.57 
 
 		 371 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  40 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  37.1 
 
 		 351 aa  104  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  37.7 
 
 		 341 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.44 
 
 		 341 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  33.72 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  37.43 
 
 		 385 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  39.78 
 
 		 340 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.2 
 
 		 419 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  39.13 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.25 
 
 		 356 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.38 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  36.26 
 
 		 1618 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  37.78 
 
 		 328 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.07 
 
 		 353 aa  101  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.68 
 
 		 340 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.85 
 
 		 350 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1322  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.67 
 
 		 424 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  37.1 
 
 		 327 aa  101  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  35.12 
 
 		 1200 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.63 
 
 		 370 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 		 1160 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.9 
 
 		 348 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  34.43 
 
 		 365 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  38.04 
 
 		 359 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  37.1 
 
 		 349 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2193  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.61 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.23 
 
 		 355 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.04 
 
 		 1371 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0334  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.71 
 
 		 355 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  41.72 
 
 		 393 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1002  CheB methylesterase  38.65 
 
 		 214 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  36.31 
 
 		 432 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3754  chemotaxis-specific methylesterase  35.59 
 
 		 349 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2187  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.48 
 
 		 355 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>