More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2803 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  100 
 
 		 201 aa  396  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  64.14 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  58.92 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  56.52 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  56.52 
 
 		 204 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  60.54 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  57.45 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  58.7 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  55.5 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  55.98 
 
 		 191 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  55.98 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  51.02 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  42.41 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  46.77 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  47.83 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  48.94 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  49.2 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  47.85 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  46.96 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  49.08 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  47.03 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  50.57 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  38.97 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  47.22 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  46.7 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  40.11 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  42.08 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  44.75 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  44.51 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  42.31 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  38.46 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  45.86 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  42.22 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  44.86 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  43.29 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  35.23 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.75 
 
 		 341 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  40.86 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.75 
 
 		 341 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.8 
 
 		 340 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  33.68 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  39.56 
 
 		 337 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 1165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  38.33 
 
 		 338 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  35.71 
 
 		 329 aa  111  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0600  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  42.13 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.98 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.36 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  35 
 
 		 347 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.64 
 
 		 353 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.64 
 
 		 1361 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  38.32 
 
 		 1170 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  40.34 
 
 		 359 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  38.32 
 
 		 1170 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  35 
 
 		 351 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  36.81 
 
 		 344 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.64 
 
 		 350 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  34.57 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.89 
 
 		 350 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2403  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.66 
 
 		 361 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  35.64 
 
 		 363 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  34.52 
 
 		 1618 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0625  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.91 
 
 		 349 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.291443  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  38.67 
 
 		 350 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  35.15 
 
 		 363 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0634  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.91 
 
 		 349 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  39.01 
 
 		 354 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1222 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  34.57 
 
 		 385 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  35.45 
 
 		 362 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  40.56 
 
 		 340 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.2 
 
 		 385 aa  104  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.56 
 
 		 371 aa  104  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  38.71 
 
 		 1483 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  31.69 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2358  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.36 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 		 363 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  33.52 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.79 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.96 
 
 		 347 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  37.43 
 
 		 379 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  32.95 
 
 		 1200 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4668  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.5 
 
 		 368 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275647  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.22 
 
 		 354 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  35.38 
 
 		 364 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  33.16 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  36.26 
 
 		 351 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.16 
 
 		 365 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.79 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 		 363 aa  101  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 993 aa  101  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.97 
 
 		 365 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.57 
 
 		 363 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1133  CheB methylesterase  33.9 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00605685  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  34.92 
 
 		 350 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  34.92 
 
 		 350 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 		 349 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  38.73 
 
 		 1160 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.17 
 
 		 1306 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.92 
 
 		 350 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>