More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5775 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  100 
 
 		 351 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  61.68 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  53.12 
 
 		 340 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  55.31 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  55.31 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  52.5 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  50.16 
 
 		 334 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  40.31 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  39.08 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  38.89 
 
 		 347 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  37.42 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  38.27 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  39.81 
 
 		 342 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  37.99 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  40.94 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  36.78 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  37.38 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  41.72 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  37 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  36.02 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  37.63 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  38.1 
 
 		 258 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  41.21 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  38.71 
 
 		 195 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  45.41 
 
 		 199 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.04 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  45.41 
 
 		 199 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  35.56 
 
 		 197 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  39.56 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  34.59 
 
 		 212 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  40.11 
 
 		 197 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  38.59 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.63 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  41.67 
 
 		 203 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  38.67 
 
 		 206 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  34.55 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2187  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.74 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  40.56 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5454  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.99 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  39.56 
 
 		 204 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  41.53 
 
 		 204 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  43.2 
 
 		 194 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  38.46 
 
 		 204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.37 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  36.46 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2840  protein-glutamate methylesterase  38.17 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3066  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.17 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.979529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2026  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.97 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.25 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  38.1 
 
 		 208 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.8 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  36.07 
 
 		 199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  40.59 
 
 		 191 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.8 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  35.23 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.61 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  38.55 
 
 		 192 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2193  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.43 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  40.59 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  40.59 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  36.76 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  36.07 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0245  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.43 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134095  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  39.56 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  37.5 
 
 		 204 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  37.16 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2958  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  38.04 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  37.16 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.36 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  37.16 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  40.56 
 
 		 191 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  39.34 
 
 		 191 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  39.88 
 
 		 203 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  39.34 
 
 		 191 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  37.91 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  39.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.69 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  39.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  39.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.76 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  38.69 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  39.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  36.87 
 
 		 193 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  39.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  38.24 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.04 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  39.88 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  38.24 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.29 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.82 
 
 		 1274 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  39.36 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1669  CheB methylesterase  36.07 
 
 		 194 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  39.01 
 
 		 191 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>