More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4208 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  100 
 
 
196 aa  386  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  69.89 
 
 
204 aa  259  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  66.67 
 
 
208 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  47.59 
 
 
206 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  55.26 
 
 
203 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  53.55 
 
 
199 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  53.01 
 
 
199 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  52.46 
 
 
204 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  45.83 
 
 
192 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  48.26 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  45.14 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  47.28 
 
 
204 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  47.67 
 
 
193 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  50 
 
 
199 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  48.91 
 
 
191 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  45.65 
 
 
204 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  48.24 
 
 
197 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  45.98 
 
 
195 aa  157  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  50.57 
 
 
201 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  48.24 
 
 
203 aa  154  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  47.85 
 
 
191 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  47.8 
 
 
191 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  47.25 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  47.25 
 
 
191 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  43.62 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  42.53 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  48.62 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  42.61 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  46.99 
 
 
203 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  48.33 
 
 
191 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  43.41 
 
 
193 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  39.77 
 
 
212 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  42.51 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  44.97 
 
 
188 aa  134  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  46.15 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  41.88 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  44.05 
 
 
211 aa  130  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  40.56 
 
 
338 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  39.13 
 
 
351 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  39.08 
 
 
205 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  39.77 
 
 
345 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  41.4 
 
 
337 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  42.69 
 
 
194 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  35.33 
 
 
329 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.98 
 
 
1361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.35 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  40.25 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.37 
 
 
353 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  41.82 
 
 
339 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.77 
 
 
353 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  37.63 
 
 
363 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.67 
 
 
369 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  41.99 
 
 
367 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  40.68 
 
 
334 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  41.99 
 
 
359 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  41.11 
 
 
360 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.76 
 
 
1399 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  38.15 
 
 
432 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  41.11 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.67 
 
 
369 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  37.06 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.25 
 
 
347 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  41.67 
 
 
363 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  40.68 
 
 
363 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2403  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.2 
 
 
361 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.9 
 
 
1306 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  42.11 
 
 
349 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4125  chemotaxis-specific methylesterase  40.38 
 
 
337 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.893624  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.02 
 
 
352 aa  111  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
371 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2235  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.03 
 
 
355 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  41.44 
 
 
362 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  37.91 
 
 
363 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  37.91 
 
 
363 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0034  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.56 
 
 
382 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  43.75 
 
 
341 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35 
 
 
1215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
363 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.5 
 
 
339 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.71 
 
 
1218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
364 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.03 
 
 
1408 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  37.7 
 
 
350 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  39.44 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.88 
 
 
365 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  40.88 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.51 
 
 
394 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.59 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  40.56 
 
 
360 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1435  chemotaxis-specific methylesterase  41.57 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  40.56 
 
 
360 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02180  chemotaxis-specific methylesterase  40.35 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.447797 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  40.56 
 
 
360 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  38.89 
 
 
364 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.51 
 
 
379 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  40.46 
 
 
349 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  39.44 
 
 
364 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  39.44 
 
 
364 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  39.44 
 
 
364 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  39.44 
 
 
364 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>