More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2640 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  100 
 
 
194 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  57.92 
 
 
196 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  52.72 
 
 
206 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  50 
 
 
193 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  50.55 
 
 
199 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  48.37 
 
 
197 aa  168  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  48.39 
 
 
190 aa  167  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  49.73 
 
 
191 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  49.73 
 
 
191 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  47.37 
 
 
199 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  48.37 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  50.27 
 
 
191 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  42.63 
 
 
202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  47.51 
 
 
204 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  45.99 
 
 
201 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  45.83 
 
 
191 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  46.74 
 
 
199 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  39.89 
 
 
197 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  49.19 
 
 
191 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  45.65 
 
 
199 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  40.86 
 
 
195 aa  151  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  43.24 
 
 
192 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  38.17 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  44.26 
 
 
203 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  41.53 
 
 
203 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  41.97 
 
 
365 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  41.24 
 
 
204 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  41.53 
 
 
205 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  44.44 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  42.39 
 
 
350 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  42.47 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  44.83 
 
 
211 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  41.08 
 
 
347 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.96 
 
 
371 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.57 
 
 
353 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  45.76 
 
 
191 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  41.53 
 
 
351 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  40.88 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.54 
 
 
385 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  39.56 
 
 
338 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  40.98 
 
 
345 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  39.89 
 
 
204 aa  130  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  40.98 
 
 
344 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  42.31 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.25 
 
 
376 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00461138  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  36.41 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  34.07 
 
 
193 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.2 
 
 
348 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0601  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.11 
 
 
344 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  34.59 
 
 
203 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  40.96 
 
 
363 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.37 
 
 
365 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 
347 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  40.43 
 
 
364 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
367 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
367 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.42 
 
 
355 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  42.78 
 
 
351 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  39.36 
 
 
354 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40 
 
 
350 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.76 
 
 
419 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  35.56 
 
 
193 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  38.29 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  37.77 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
360 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
360 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
360 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2298  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.49 
 
 
338 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981818  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.25 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.76 
 
 
370 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 
371 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.98 
 
 
379 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  38.89 
 
 
337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  39.36 
 
 
367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.56 
 
 
352 aa  118  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  38.83 
 
 
363 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.23 
 
 
356 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  38.5 
 
 
349 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.06 
 
 
356 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  36.79 
 
 
363 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  38.8 
 
 
327 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  38.62 
 
 
362 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  39.11 
 
 
349 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  38.86 
 
 
363 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  35.14 
 
 
344 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  35.14 
 
 
344 aa  117  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  38.8 
 
 
363 aa  117  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.34 
 
 
361 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0743  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
424 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.67 
 
 
384 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.17 
 
 
354 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>