More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4245 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  51.56 
 
 
193 aa  218  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  52.91 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  46.32 
 
 
194 aa  188  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  53.07 
 
 
188 aa  178  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  43.58 
 
 
206 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  44.69 
 
 
197 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  40.66 
 
 
196 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  42.94 
 
 
191 aa  148  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  44.07 
 
 
186 aa  147  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  42.46 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  39.34 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  40 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  39.46 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  41.14 
 
 
204 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  41.88 
 
 
202 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  40.44 
 
 
197 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  41.95 
 
 
195 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  39.89 
 
 
204 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  39.56 
 
 
190 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  41.53 
 
 
191 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  37.99 
 
 
192 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  40.32 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  37.5 
 
 
199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  36.96 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  40.32 
 
 
191 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  37.36 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  41.88 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  39.66 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  35.68 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  35.23 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  38.12 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  37.57 
 
 
208 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1133  CheB methylesterase  38.61 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00605685  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  34.73 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  36.02 
 
 
329 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  37.14 
 
 
338 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  37.08 
 
 
189 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  36.88 
 
 
344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  35.84 
 
 
344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  33.87 
 
 
344 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  36.78 
 
 
351 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  32.97 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  36.05 
 
 
345 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  31.98 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  35.59 
 
 
183 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  30.86 
 
 
212 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  34.24 
 
 
339 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  34.3 
 
 
347 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  32.22 
 
 
337 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  36.88 
 
 
344 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  36.2 
 
 
355 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  35.67 
 
 
191 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  33.33 
 
 
354 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  35.39 
 
 
328 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.44 
 
 
353 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  33.15 
 
 
340 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  34.55 
 
 
345 aa  96.3  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  32.78 
 
 
340 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  30.34 
 
 
350 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  30.85 
 
 
401 aa  94.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  30.11 
 
 
327 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.18 
 
 
365 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.05 
 
 
419 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2125  CheB methylesterase  32.95 
 
 
197 aa  92  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  30.57 
 
 
365 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  33.96 
 
 
330 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  35.26 
 
 
856 aa  92.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.15 
 
 
379 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  32.42 
 
 
342 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  31.64 
 
 
334 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  31.52 
 
 
364 aa  91.7  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  36.08 
 
 
342 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  29.48 
 
 
351 aa  91.3  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  31.46 
 
 
1149 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2193  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.52 
 
 
351 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  30.73 
 
 
341 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.9 
 
 
1158 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  33.71 
 
 
1170 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.2 
 
 
358 aa  89  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 
1170 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.94 
 
 
340 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  33.15 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1344 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
1008 aa  87.8  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2028  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.98 
 
 
356 aa  87  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  30.05 
 
 
376 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 
1165 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2821  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.63 
 
 
364 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.148608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  30.86 
 
 
370 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.17 
 
 
385 aa  85.9  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.44 
 
 
1499 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  33.75 
 
 
349 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  30.67 
 
 
347 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.25 
 
 
361 aa  85.5  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  31.74 
 
 
385 aa  85.5  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  32.92 
 
 
334 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2826  CheB methylesterase  31.61 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.22 
 
 
339 aa  84.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.84 
 
 
1303 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>