More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2078 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  100 
 
 
197 aa  400  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  49.74 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  47.8 
 
 
199 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  44.26 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  45.5 
 
 
193 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  45.14 
 
 
196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  41.94 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  41.27 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  41.58 
 
 
199 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  41.44 
 
 
204 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  40.33 
 
 
204 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  40.32 
 
 
212 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  43.65 
 
 
203 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  38.07 
 
 
199 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  38.58 
 
 
199 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  43.09 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  42.16 
 
 
191 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  44.69 
 
 
193 aa  154  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  40.21 
 
 
208 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  40.64 
 
 
204 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  45.51 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  38.92 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  40 
 
 
196 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  38.97 
 
 
201 aa  151  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  42.77 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  44.94 
 
 
191 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  41.11 
 
 
203 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  41.24 
 
 
193 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  43.82 
 
 
191 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  40.93 
 
 
197 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  42.37 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  43.09 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  37.64 
 
 
211 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  37.99 
 
 
194 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  39.56 
 
 
203 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  36.27 
 
 
204 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  39.13 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  39.89 
 
 
194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.22 
 
 
352 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.68 
 
 
365 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  36.26 
 
 
329 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  35.56 
 
 
351 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  38.12 
 
 
191 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.98 
 
 
341 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.98 
 
 
341 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.17 
 
 
353 aa  124  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  38.33 
 
 
351 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.78 
 
 
340 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2403  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.97 
 
 
361 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  36.9 
 
 
347 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
354 aa  121  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  36.9 
 
 
401 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.44 
 
 
356 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  36.11 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  36.07 
 
 
338 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2187  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.97 
 
 
355 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.85 
 
 
341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.2 
 
 
367 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  35.56 
 
 
345 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.2 
 
 
367 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3066  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.21 
 
 
361 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.285498  normal  0.979529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2840  protein-glutamate methylesterase  30.21 
 
 
361 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.15 
 
 
347 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2711  chemotaxis-specific methylesterase  36.41 
 
 
350 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  36.42 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.44 
 
 
1759 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.97 
 
 
352 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.39 
 
 
1361 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3079  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.52 
 
 
362 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  34.39 
 
 
362 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  34.18 
 
 
363 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.87 
 
 
346 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0626  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.43 
 
 
394 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0245  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.78 
 
 
355 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134095  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.87 
 
 
365 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.07 
 
 
356 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  36.46 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30 
 
 
1248 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  33.67 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  36.46 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.35 
 
 
361 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  35.38 
 
 
363 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  33.89 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2358  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.08 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5454  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.95 
 
 
355 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.81 
 
 
1233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2958  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.89 
 
 
361 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  34.81 
 
 
367 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  33.7 
 
 
364 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.81 
 
 
357 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0985  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.78 
 
 
395 aa  112  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.239072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  35.23 
 
 
344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  34.62 
 
 
362 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  35.33 
 
 
345 aa  111  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  33.69 
 
 
387 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.22 
 
 
339 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0994  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.15 
 
 
346 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  35.36 
 
 
363 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  35.64 
 
 
385 aa  111  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.66 
 
 
365 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>