More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0390 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  54.69 
 
 		 203 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  51.56 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  53.09 
 
 		 194 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  51.1 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  45.69 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  44.39 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  43.65 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  42.78 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  45 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  45.11 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  51.25 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  42.16 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  43.02 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  41.24 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  43.09 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  46.07 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  46.07 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  41.71 
 
 		 199 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  42.08 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  39.78 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  40.32 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  41.44 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  40.22 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  41.99 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  40.88 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  43.41 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  39.44 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  37.57 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  44.07 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  45.05 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  37.57 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  43.41 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  41.01 
 
 		 199 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  38.67 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  41.99 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  37.02 
 
 		 337 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  37.36 
 
 		 338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  32.04 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  36.71 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  35.16 
 
 		 351 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  38.67 
 
 		 341 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1133  CheB methylesterase  36.11 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00605685  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  35.2 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  40.48 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  36.81 
 
 		 329 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  36.87 
 
 		 351 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  34.27 
 
 		 345 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  34.68 
 
 		 344 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  34.68 
 
 		 344 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  32.97 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  34.91 
 
 		 347 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  33.7 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  35.67 
 
 		 339 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  32.18 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1002  CheB methylesterase  37.17 
 
 		 214 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  32.24 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  35.54 
 
 		 340 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  32.97 
 
 		 342 aa  98.2  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  34.25 
 
 		 340 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  31.41 
 
 		 1200 aa  96.7  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.45 
 
 		 385 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  32.95 
 
 		 344 aa  96.3  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  37.11 
 
 		 334 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.64 
 
 		 350 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  34.81 
 
 		 354 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.35 
 
 		 353 aa  94  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.8 
 
 		 356 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  28.8 
 
 		 365 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 		 340 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2125  CheB methylesterase  34.88 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.97 
 
 		 371 aa  91.3  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  29.55 
 
 		 345 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  36.75 
 
 		 328 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  31.35 
 
 		 364 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  31.21 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.56 
 
 		 353 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  37.18 
 
 		 342 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  34.32 
 
 		 258 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.51 
 
 		 366 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  30.57 
 
 		 365 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.07 
 
 		 394 aa  87.8  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  34.86 
 
 		 330 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.89 
 
 		 360 aa  87.8  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.63 
 
 		 370 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1008 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1729  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.28 
 
 		 366 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  34.91 
 
 		 1170 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  31.68 
 
 		 393 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2187  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.32 
 
 		 355 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 		 1170 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0034  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  28.81 
 
 		 382 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.44 
 
 		 351 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.33 
 
 		 1215 aa  85.5  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2126  protein-glutamate methylesterase CheB  29.71 
 
 		 351 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.32 
 
 		 352 aa  85.1  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.44 
 
 		 351 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  30.64 
 
 		 355 aa  84.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.06 
 
 		 341 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1344 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>