More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5355 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  100 
 
 
191 aa  376  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  49.45 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  50.83 
 
 
204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  53.57 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  55.9 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  53.01 
 
 
199 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  55.21 
 
 
203 aa  177  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  54.04 
 
 
193 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  55.42 
 
 
203 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  53.7 
 
 
197 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  50.92 
 
 
204 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  49.69 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  52.76 
 
 
202 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  45.05 
 
 
206 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  51.53 
 
 
191 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  48.09 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  52.81 
 
 
189 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  50.93 
 
 
195 aa  160  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  46.99 
 
 
191 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  44.62 
 
 
196 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  49.09 
 
 
191 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  49.08 
 
 
201 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  47.24 
 
 
190 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  47.85 
 
 
196 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  42.77 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  39.78 
 
 
203 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  42.94 
 
 
193 aa  148  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  39.78 
 
 
193 aa  147  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  45.68 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  43.96 
 
 
188 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  45.83 
 
 
194 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  52.2 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  49.06 
 
 
204 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  47.8 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  46.63 
 
 
211 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  40.99 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  40.11 
 
 
186 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  34.59 
 
 
212 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  40.99 
 
 
338 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.05 
 
 
365 aa  121  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0334  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 
355 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.41 
 
 
367 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.41 
 
 
367 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  40.62 
 
 
205 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.12 
 
 
353 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.92 
 
 
370 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  38.41 
 
 
344 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  38.41 
 
 
344 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  39.39 
 
 
367 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
362 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
362 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  40.25 
 
 
344 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  35.8 
 
 
356 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  39.2 
 
 
340 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  37.58 
 
 
364 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.6 
 
 
385 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  37.35 
 
 
357 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
350 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0601  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.12 
 
 
344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
350 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  39.88 
 
 
347 aa  111  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
363 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
363 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  39.41 
 
 
362 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
360 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
360 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
360 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  39.13 
 
 
340 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
360 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1373  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.82 
 
 
356 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.08 
 
 
352 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  37.58 
 
 
350 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  37.58 
 
 
350 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  36.42 
 
 
356 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.27 
 
 
355 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  38.79 
 
 
363 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  38.18 
 
 
349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  40.59 
 
 
351 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  36.69 
 
 
362 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.8 
 
 
347 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  40.24 
 
 
363 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.91 
 
 
339 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.54 
 
 
354 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  38.89 
 
 
350 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.02 
 
 
350 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.81 
 
 
361 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  36.97 
 
 
349 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.04 
 
 
353 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  37.58 
 
 
359 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.77 
 
 
350 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2467  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.2 
 
 
369 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272955  normal  0.0644131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  35.98 
 
 
349 aa  107  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>