More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2144 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  86.91 
 
 		 191 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  86.39 
 
 		 191 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  82.2 
 
 		 191 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  62.23 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  62.77 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  61.05 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  60.64 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  58.7 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  59.57 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  54.64 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  51.63 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  52.49 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  51.38 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  50.84 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  45.7 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  47.8 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  50 
 
 		 196 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  47.8 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  48.91 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  50.55 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  49.09 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  45.9 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  43.65 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  43.82 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  48.84 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  38.83 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  46.63 
 
 		 189 aa  144  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  43.89 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  45.74 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  45.21 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  50.59 
 
 		 191 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  37.63 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  45.18 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  39.66 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  38.33 
 
 		 212 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  43.89 
 
 		 337 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  40.12 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.81 
 
 		 341 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  42.31 
 
 		 342 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.81 
 
 		 341 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  40.32 
 
 		 347 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.33 
 
 		 340 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  42.77 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  41.94 
 
 		 354 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  40.11 
 
 		 338 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  39.44 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.91 
 
 		 347 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0988  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.61 
 
 		 350 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00710031  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  39.25 
 
 		 345 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.21 
 
 		 371 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  43.17 
 
 		 341 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.52 
 
 		 352 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.17 
 
 		 385 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  45.91 
 
 		 258 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  39.23 
 
 		 387 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  40.11 
 
 		 334 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  41.11 
 
 		 340 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  39.44 
 
 		 351 aa  111  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  39.25 
 
 		 350 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  43.4 
 
 		 328 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  40.99 
 
 		 339 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  39.23 
 
 		 344 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 		 419 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  44.91 
 
 		 341 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.66 
 
 		 366 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.92 
 
 		 356 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  41.21 
 
 		 425 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35 
 
 		 1361 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  38.55 
 
 		 385 aa  107  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  40.99 
 
 		 393 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.43 
 
 		 360 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  36.21 
 
 		 401 aa  107  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  40.56 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  41.57 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.16 
 
 		 350 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  45.81 
 
 		 342 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.86 
 
 		 355 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  37.78 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1435  chemotaxis-specific methylesterase  40.56 
 
 		 335 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.88 
 
 		 369 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.78 
 
 		 353 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 381 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  40.11 
 
 		 354 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16480  chemotaxis-specific methylesterase  40.56 
 
 		 335 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00306037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.64 
 
 		 369 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.68 
 
 		 339 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0282  chemotaxis-specific methylesterase  39.44 
 
 		 341 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 		 370 aa  104  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1330  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.33 
 
 		 351 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  31.49 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.08 
 
 		 358 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  39.2 
 
 		 359 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  37.89 
 
 		 349 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.37 
 
 		 379 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3803  chemotaxis-specific methylesterase  35.26 
 
 		 349 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.22 
 
 		 340 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0161  protein-glutamate methylesterase CheB  40.11 
 
 		 395 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2467  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.61 
 
 		 369 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272955  normal  0.0644131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3754  chemotaxis-specific methylesterase  35.26 
 
 		 349 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>