More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5177 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  100 
 
 
345 aa  713    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  54.15 
 
 
347 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  52.65 
 
 
351 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  49.2 
 
 
329 aa  315  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  44.12 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  43.57 
 
 
337 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  42.73 
 
 
338 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  43.15 
 
 
341 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  37.32 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  35.49 
 
 
334 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  41.84 
 
 
350 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  41.04 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  36.44 
 
 
354 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  35.15 
 
 
327 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  38.24 
 
 
351 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  35.98 
 
 
340 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  38.69 
 
 
342 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  41.2 
 
 
328 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  37.28 
 
 
342 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  33.94 
 
 
339 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  36.27 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  36.33 
 
 
258 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  39.29 
 
 
206 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  38.17 
 
 
212 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  35.23 
 
 
205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  38.89 
 
 
196 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  40.88 
 
 
190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.11 
 
 
347 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  39.77 
 
 
196 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  37.29 
 
 
193 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  36.26 
 
 
195 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  40.46 
 
 
194 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.04 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  38.89 
 
 
197 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  35.33 
 
 
192 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  37.82 
 
 
202 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  35.06 
 
 
1200 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  39.13 
 
 
199 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.67 
 
 
1361 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.38 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  35.56 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  35.83 
 
 
199 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  35.83 
 
 
199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.87 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  36.81 
 
 
204 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.22 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.66 
 
 
394 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  38.46 
 
 
208 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.43 
 
 
371 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  38.62 
 
 
191 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  39.25 
 
 
191 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  37.11 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  34.01 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  36.96 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  37.11 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.76 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  37.11 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.26 
 
 
419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.31 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.48 
 
 
356 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  33.33 
 
 
364 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  31.86 
 
 
879 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  37.36 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.22 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  39.36 
 
 
363 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.76 
 
 
362 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  37.87 
 
 
204 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.36 
 
 
1698 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.02 
 
 
352 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.14 
 
 
355 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  34.76 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  34.76 
 
 
354 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  112  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.91 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.76 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  37.08 
 
 
364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  36.08 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.76 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  37.63 
 
 
191 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1328  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000107644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.91 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  37.63 
 
 
191 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.22 
 
 
852 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1857  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.85 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  35.57 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.02 
 
 
364 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  36.08 
 
 
349 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 
1008 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>