More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3575 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  100 
 
 
341 aa  691    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  44.85 
 
 
329 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  42.38 
 
 
347 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  43.15 
 
 
345 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  44.1 
 
 
338 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  39.33 
 
 
344 aa  255  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  45.12 
 
 
337 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  42.81 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  39.16 
 
 
334 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  40.94 
 
 
354 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  38.15 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  41.77 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  42.42 
 
 
342 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  40.62 
 
 
340 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  40.94 
 
 
351 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  40 
 
 
330 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  37.39 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  40.07 
 
 
350 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  44.14 
 
 
258 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  34.04 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  34.78 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  37.68 
 
 
328 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  42.86 
 
 
208 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  39.44 
 
 
192 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  42.47 
 
 
204 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  46.78 
 
 
199 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  41.36 
 
 
204 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  45.6 
 
 
199 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  40.66 
 
 
204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  39.34 
 
 
205 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.84 
 
 
1361 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  39.13 
 
 
195 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  44.12 
 
 
190 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  40.66 
 
 
199 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.13 
 
 
1274 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4532  CheB methylesterase  43.6 
 
 
197 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  37.57 
 
 
1027 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  40.88 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  43.75 
 
 
196 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  35.68 
 
 
1200 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  42.54 
 
 
191 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.69 
 
 
1167 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  41.76 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  38.17 
 
 
206 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  41.67 
 
 
203 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  38.67 
 
 
193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
1222 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  40.64 
 
 
432 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  44.91 
 
 
191 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  39.36 
 
 
197 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  32.98 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  39.78 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.22 
 
 
1218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  34.04 
 
 
212 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.43 
 
 
1371 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  43.1 
 
 
191 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.81 
 
 
1010 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  40.43 
 
 
191 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  42.77 
 
 
204 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  43.1 
 
 
191 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  39.05 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  37.22 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6342  CheB methylesterase  36.56 
 
 
336 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
371 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2649  CheB methylesterase  35.48 
 
 
195 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115234  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  38.14 
 
 
363 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  34.9 
 
 
203 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  36.69 
 
 
820 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 
355 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  41.88 
 
 
191 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.87 
 
 
347 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  37.06 
 
 
363 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  39.13 
 
 
203 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  38.67 
 
 
1160 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.96 
 
 
356 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.1 
 
 
355 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.96 
 
 
356 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
362 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.4 
 
 
852 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.3 
 
 
419 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.12 
 
 
1380 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
877 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.23 
 
 
1233 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.91 
 
 
365 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  37.5 
 
 
1384 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.35 
 
 
364 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  36.57 
 
 
980 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.91 
 
 
365 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  32.62 
 
 
197 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  35.03 
 
 
194 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.21 
 
 
354 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.66 
 
 
341 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.34 
 
 
1759 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  38.12 
 
 
188 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  33.86 
 
 
376 aa  102  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.43 
 
 
1408 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  39.43 
 
 
201 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.88 
 
 
341 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  38.04 
 
 
354 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  39.08 
 
 
199 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>