More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1963 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  51.38 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  51.06 
 
 
195 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  49.45 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  47.8 
 
 
197 aa  181  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  47.8 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  47.85 
 
 
190 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  49.4 
 
 
194 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  48.26 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  45.3 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  45.3 
 
 
199 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  48.02 
 
 
204 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  44.2 
 
 
202 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  48.59 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  43.09 
 
 
204 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  43.89 
 
 
212 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  42.08 
 
 
192 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  44.75 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  46.33 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  43.09 
 
 
199 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  42.46 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  43.82 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  45.68 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  44.75 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  38.3 
 
 
203 aa  144  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  43.65 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  43.89 
 
 
191 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.31 
 
 
365 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  41.99 
 
 
203 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  41.76 
 
 
203 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  44.13 
 
 
191 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  42.86 
 
 
191 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  42.86 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  43.65 
 
 
197 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  41.01 
 
 
193 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  40.22 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  42.7 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  40 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  40.44 
 
 
365 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  39.66 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  42.37 
 
 
363 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.04 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  39.66 
 
 
329 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  41.24 
 
 
359 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  42.37 
 
 
364 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  44.44 
 
 
191 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  39.44 
 
 
186 aa  124  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
360 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0170  chemotaxis-specific methylesterase  42.37 
 
 
363 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.425756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
360 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0261  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
360 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.22 
 
 
354 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
364 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
364 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
364 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
364 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
364 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
364 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 
339 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  37.3 
 
 
211 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.33 
 
 
377 aa  121  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  41.24 
 
 
367 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
363 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
360 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  39.66 
 
 
338 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3809  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  37.43 
 
 
351 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  39.77 
 
 
363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  38.33 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  36.46 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1571  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 
369 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.421164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.34 
 
 
340 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
363 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  35.45 
 
 
349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  39.13 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  40.44 
 
 
349 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  39.44 
 
 
363 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.11 
 
 
367 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.91 
 
 
384 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 
350 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  38.98 
 
 
350 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.67 
 
 
341 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 
350 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  38.98 
 
 
350 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0173  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.42 
 
 
366 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0415751  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  38.64 
 
 
356 aa  115  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0733  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.99 
 
 
366 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  38.98 
 
 
349 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.59 
 
 
350 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.99 
 
 
384 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.06 
 
 
353 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.86 
 
 
376 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  38.42 
 
 
357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  36.87 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2938  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.91 
 
 
346 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.44 
 
 
385 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.84 
 
 
366 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>