More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1032 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  54.69 
 
 
193 aa  230  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  52.91 
 
 
193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  52.06 
 
 
194 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  54.49 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  44.26 
 
 
195 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  49.41 
 
 
199 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  50 
 
 
199 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  44.32 
 
 
203 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  42.19 
 
 
206 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  42.7 
 
 
192 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  43.65 
 
 
197 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  42.62 
 
 
204 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  48.24 
 
 
196 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  42.86 
 
 
199 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  45.29 
 
 
190 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  40.72 
 
 
203 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  48.8 
 
 
186 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  42.78 
 
 
197 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  39.78 
 
 
191 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  40.11 
 
 
201 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  40.86 
 
 
204 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  39.04 
 
 
196 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  38.92 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  42.02 
 
 
191 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  38.83 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  41.67 
 
 
204 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  38.3 
 
 
199 aa  144  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  39.25 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  39.78 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  40.45 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  38.17 
 
 
191 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  38.92 
 
 
204 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  39.46 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  37.78 
 
 
337 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  36.67 
 
 
211 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1133  CheB methylesterase  41.88 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00605685  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  36.16 
 
 
351 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  38.51 
 
 
338 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  34.68 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  31.32 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  32.83 
 
 
205 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  33.92 
 
 
344 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  36.67 
 
 
191 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  33.92 
 
 
344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  40 
 
 
340 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  33.53 
 
 
344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  34.92 
 
 
329 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.03 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.03 
 
 
358 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  32.78 
 
 
183 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.11 
 
 
365 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.28 
 
 
353 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  33.15 
 
 
345 aa  104  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  32.97 
 
 
342 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  36.9 
 
 
340 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  34.9 
 
 
341 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  32.61 
 
 
345 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.2 
 
 
385 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  33.52 
 
 
376 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1344 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2026  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.89 
 
 
351 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  32.63 
 
 
344 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  31.28 
 
 
351 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  34.59 
 
 
363 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  32.95 
 
 
1200 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  36.99 
 
 
354 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  34.52 
 
 
182 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  30 
 
 
401 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.09 
 
 
371 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  33.72 
 
 
347 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.79 
 
 
371 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  31.21 
 
 
355 aa  98.6  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.55 
 
 
360 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0394  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.35 
 
 
352 aa  98.6  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000553759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0959  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.54 
 
 
402 aa  98.2  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1037  CheB methylesterase  31.69 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2125  CheB methylesterase  33.71 
 
 
197 aa  98.2  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2826  CheB methylesterase  34.25 
 
 
187 aa  97.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205852 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.3 
 
 
1361 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0943  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.61 
 
 
354 aa  97.1  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.24 
 
 
356 aa  97.1  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  29.1 
 
 
327 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.93 
 
 
386 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2117  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.67 
 
 
352 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6788  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.05 
 
 
343 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.05 
 
 
363 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  32.92 
 
 
393 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2193  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.81 
 
 
351 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.55 
 
 
339 aa  95.5  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  29.32 
 
 
385 aa  95.5  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.18 
 
 
350 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.46 
 
 
365 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2028  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.81 
 
 
356 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
340 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02866  chemotaxis-specific methylesterase  31.84 
 
 
369 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.41 
 
 
384 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  34.66 
 
 
1165 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  32.97 
 
 
350 aa  94.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 
1170 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>