More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2259 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  51.25 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  48.8 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  44.07 
 
 		 193 aa  147  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  46.37 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  43.32 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  39.13 
 
 		 197 aa  140  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  42.46 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  40.56 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  46.06 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  45.45 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  38.67 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  48.1 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  45.4 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  46.15 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  45.18 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  40 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  44.79 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  43.29 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  44.72 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  43.82 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  39.78 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  44.1 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  37.78 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  42.68 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  37.22 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  42.33 
 
 		 191 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  39.44 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  40.78 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  42.59 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  40.11 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  39.34 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  39.02 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  43.33 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  39.63 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  36.97 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  40.37 
 
 		 337 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  37.42 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  35.19 
 
 		 329 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  36.49 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  32.93 
 
 		 344 aa  100  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  32.93 
 
 		 344 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  38.55 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1133  CheB methylesterase  32.14 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00605685  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  38.27 
 
 		 334 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  41.57 
 
 		 354 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.36 
 
 		 348 aa  97.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3102  dethiobiotin synthase  32.75 
 
 		 348 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  37.65 
 
 		 338 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  32.1 
 
 		 344 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  40.35 
 
 		 340 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.76 
 
 		 353 aa  95.9  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  37.65 
 
 		 328 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  31.89 
 
 		 401 aa  95.5  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.33 
 
 		 340 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  40.74 
 
 		 342 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.33 
 
 		 341 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  31.67 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.33 
 
 		 341 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.09 
 
 		 340 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2403  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.34 
 
 		 361 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  33.33 
 
 		 1618 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  35.33 
 
 		 262 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2286  chemotaxis-specific methylesterase  34.13 
 
 		 380 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.13 
 
 		 339 aa  91.3  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  33.73 
 
 		 345 aa  90.9  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0219  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.53 
 
 		 362 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  35.76 
 
 		 354 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0154  protein-glutamate methylesterase CheB  31.4 
 
 		 346 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0887  CheB methylesterase  33.89 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339735  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.57 
 
 		 347 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  34.16 
 
 		 345 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1010 aa  89.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  31.25 
 
 		 1337 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  36.53 
 
 		 334 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2467  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  31.93 
 
 		 369 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272955  normal  0.0644131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  29.9 
 
 		 365 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  34.36 
 
 		 341 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2125  CheB methylesterase  35 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  29.84 
 
 		 387 aa  87.8  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  39.51 
 
 		 340 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0034  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.72 
 
 		 382 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0161  protein-glutamate methylesterase CheB  35.15 
 
 		 395 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  33.74 
 
 		 364 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.75 
 
 		 1215 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  33.51 
 
 		 868 aa  86.3  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.34 
 
 		 1361 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.77 
 
 		 360 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  32.3 
 
 		 351 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  33.73 
 
 		 432 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.32 
 
 		 367 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  30.43 
 
 		 339 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.32 
 
 		 367 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1037  CheB methylesterase  33.33 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  30.67 
 
 		 355 aa  85.9  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.94 
 
 		 394 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 		 356 aa  85.5  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002836  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB  31.14 
 
 		 370 aa  85.5  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1650  chemotaxis-specific methylesterase  32.53 
 
 		 377 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  32.93 
 
 		 347 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>