More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3829 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  100 
 
 
204 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  67.2 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  67.2 
 
 
199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  65.05 
 
 
203 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  50.82 
 
 
192 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  50.83 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  52.46 
 
 
196 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  51.65 
 
 
197 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  48.04 
 
 
208 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  50.79 
 
 
204 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  49.45 
 
 
189 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  49.45 
 
 
199 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  45.95 
 
 
195 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  46.74 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  47.85 
 
 
201 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  51.85 
 
 
203 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  40.4 
 
 
206 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  43.3 
 
 
204 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  50.55 
 
 
191 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  45.86 
 
 
202 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  42.62 
 
 
203 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  43.09 
 
 
199 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  44.62 
 
 
196 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  48.9 
 
 
191 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  45.36 
 
 
204 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  47.56 
 
 
193 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  43.89 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  47.57 
 
 
191 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  45.11 
 
 
193 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  55.97 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  47.03 
 
 
191 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  41.11 
 
 
194 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  36.27 
 
 
197 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  40.56 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  36.76 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  37.36 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  42.54 
 
 
211 aa  124  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  40.66 
 
 
337 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  40 
 
 
194 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  41.53 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  36.67 
 
 
338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  37.8 
 
 
205 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  45 
 
 
342 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  36.11 
 
 
347 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  40.85 
 
 
340 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.98 
 
 
350 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  42.59 
 
 
354 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  39.13 
 
 
327 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  35 
 
 
345 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  40.74 
 
 
340 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.72 
 
 
339 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.38 
 
 
379 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.67 
 
 
347 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  36.81 
 
 
334 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  34.44 
 
 
351 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.62 
 
 
419 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  35.19 
 
 
344 aa  104  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  34.59 
 
 
329 aa  104  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 
432 aa  104  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.72 
 
 
1348 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  33.53 
 
 
262 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  37.24 
 
 
363 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  35.38 
 
 
363 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.75 
 
 
1499 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  42.77 
 
 
341 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.52 
 
 
354 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  32.42 
 
 
362 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.62 
 
 
371 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.88 
 
 
363 aa  101  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  37.65 
 
 
824 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.93 
 
 
365 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  35.98 
 
 
385 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  39.68 
 
 
330 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.54 
 
 
353 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  34.18 
 
 
1618 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.55 
 
 
350 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2281  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.71 
 
 
361 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.19 
 
 
385 aa  98.6  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  40.25 
 
 
258 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1002  CheB methylesterase  41.55 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.84 
 
 
1306 aa  98.2  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  30.5 
 
 
1399 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.94 
 
 
356 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0034  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.35 
 
 
382 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
354 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.8 
 
 
355 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.38 
 
 
352 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  32.8 
 
 
365 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  40.88 
 
 
328 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.64 
 
 
358 aa  97.1  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  28.49 
 
 
344 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  35 
 
 
350 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  28.49 
 
 
344 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  31.87 
 
 
1337 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  33.54 
 
 
1200 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1322  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.43 
 
 
424 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0429  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.97 
 
 
361 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41728  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  29.27 
 
 
344 aa  95.9  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.86 
 
 
364 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2125  CheB methylesterase  33.52 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>