More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3103 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  100 
 
 
344 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  58.84 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  48.32 
 
 
351 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  46.65 
 
 
347 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  44.12 
 
 
345 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  44.75 
 
 
338 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  40.82 
 
 
337 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  39.33 
 
 
341 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  39.08 
 
 
351 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  39.1 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  39.4 
 
 
330 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  37.46 
 
 
327 aa  229  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  38.58 
 
 
334 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  41.42 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  36.75 
 
 
354 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  38.05 
 
 
340 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  39.29 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  36.59 
 
 
342 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  39.93 
 
 
328 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  37.85 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  36.62 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  38.82 
 
 
258 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  43.39 
 
 
196 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  41.99 
 
 
206 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  39.46 
 
 
212 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  35.68 
 
 
205 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  38.92 
 
 
211 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.46 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  39.66 
 
 
199 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  39.23 
 
 
193 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  39.78 
 
 
190 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  39.52 
 
 
208 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  33.68 
 
 
199 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  40.25 
 
 
196 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  36.11 
 
 
197 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  34.03 
 
 
199 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.84 
 
 
341 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  39.53 
 
 
194 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  36.26 
 
 
203 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.84 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  36.26 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  35.42 
 
 
364 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  38.32 
 
 
204 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  39.01 
 
 
197 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  37.5 
 
 
204 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  40.25 
 
 
191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  38.62 
 
 
191 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.99 
 
 
1698 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.29 
 
 
371 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  32.97 
 
 
1200 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0601  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.16 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.36 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2383  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.46 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1428  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.68 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.11 
 
 
1759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  33.87 
 
 
193 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.06 
 
 
971 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  36.26 
 
 
199 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2474  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.71 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0236682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.71 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 
356 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  40.25 
 
 
192 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  34.64 
 
 
375 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  34.64 
 
 
375 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0626  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.64 
 
 
394 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  36.41 
 
 
204 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  39.23 
 
 
191 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2214  protein-glutamate methylesterase  36.72 
 
 
371 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  34.83 
 
 
344 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2484  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.41 
 
 
356 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.900562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4309  protein-glutamate methylesterase  36.46 
 
 
364 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1383  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.71 
 
 
362 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.22 
 
 
340 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  34.39 
 
 
362 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2580  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.41 
 
 
356 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  36.81 
 
 
201 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  37.63 
 
 
191 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.16 
 
 
887 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  34.86 
 
 
363 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  33.04 
 
 
820 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  34.44 
 
 
262 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.46 
 
 
365 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.02 
 
 
365 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.36 
 
 
369 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  35 
 
 
202 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.78 
 
 
361 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.83 
 
 
364 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  36.76 
 
 
191 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  35.16 
 
 
401 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  39.33 
 
 
189 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  37.1 
 
 
191 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36 
 
 
355 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  33.68 
 
 
347 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2616  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.57 
 
 
356 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1597  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.57 
 
 
356 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.39 
 
 
363 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.94 
 
 
1306 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3257  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.68 
 
 
365 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.81 
 
 
344 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>