More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0020 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  100 
 
 
196 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  53.26 
 
 
193 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  52.06 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  57.92 
 
 
194 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  49.45 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  47.28 
 
 
190 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  43.48 
 
 
195 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  47.57 
 
 
203 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  47.8 
 
 
197 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  47.8 
 
 
192 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  50 
 
 
191 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  46.45 
 
 
199 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  48.07 
 
 
204 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  44.39 
 
 
193 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  46.45 
 
 
199 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  44.62 
 
 
191 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  47.03 
 
 
201 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  45.9 
 
 
338 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  44.62 
 
 
204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  40.66 
 
 
193 aa  154  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  48.65 
 
 
191 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  45.3 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  48.35 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  40 
 
 
197 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  48.35 
 
 
191 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  41.4 
 
 
202 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  42.39 
 
 
351 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  45.7 
 
 
203 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  42.78 
 
 
329 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  39.04 
 
 
203 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  43.6 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  44.62 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  42.53 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  43.39 
 
 
344 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  44.21 
 
 
365 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  43.01 
 
 
199 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  41.58 
 
 
205 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  46.07 
 
 
189 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  40.7 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  41.53 
 
 
188 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  39.56 
 
 
194 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  42.86 
 
 
337 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0200  chemotaxis-specific methylesterase  41.34 
 
 
355 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  36.41 
 
 
212 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  40.11 
 
 
347 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  39.56 
 
 
350 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.11 
 
 
385 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.84 
 
 
353 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  38.71 
 
 
344 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  38.89 
 
 
345 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  45.05 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  38.71 
 
 
344 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.27 
 
 
365 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.04 
 
 
360 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  39.78 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.41 
 
 
339 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  43.01 
 
 
349 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.47 
 
 
350 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.78 
 
 
371 aa  124  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  39.44 
 
 
327 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  41.3 
 
 
347 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 
419 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  38.29 
 
 
345 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1037  CheB methylesterase  37.7 
 
 
189 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0489  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.42 
 
 
354 aa  121  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.37 
 
 
384 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  37.17 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.64 
 
 
379 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  39.66 
 
 
363 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1669  CheB methylesterase  38.42 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  36.61 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0161  protein-glutamate methylesterase CheB  37.89 
 
 
395 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  38.67 
 
 
354 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  39.66 
 
 
363 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  37.5 
 
 
339 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  34.41 
 
 
344 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  39.89 
 
 
356 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.43 
 
 
355 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  41.34 
 
 
364 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  39.11 
 
 
357 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  40.56 
 
 
351 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  38.04 
 
 
334 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.98 
 
 
356 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0579  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  37.43 
 
 
385 aa  116  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1538  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 
357 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.30172  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.07 
 
 
340 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.39 
 
 
352 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4153  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 
392 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  40.78 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  40.78 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  40.78 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  40.78 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  40.78 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  40.78 
 
 
364 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.64 
 
 
364 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0878  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.11 
 
 
378 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0253  chemotaxis-specific methylesterase  39.01 
 
 
349 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  35.71 
 
 
387 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22570  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.35 
 
 
353 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2028  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.08 
 
 
356 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>