More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1646 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  100 
 
 
193 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  53.26 
 
 
196 aa  215  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  54.05 
 
 
206 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  52.11 
 
 
195 aa  188  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  54.04 
 
 
191 aa  175  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  50 
 
 
194 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  51.11 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  47.8 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  45.5 
 
 
197 aa  171  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  49.72 
 
 
204 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  49.17 
 
 
204 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  46.7 
 
 
192 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  50.84 
 
 
191 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  46.96 
 
 
199 aa  167  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  46.96 
 
 
199 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  47.78 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  45 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  50.28 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  46.96 
 
 
201 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  46.67 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  49.72 
 
 
191 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  47.67 
 
 
196 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  49.72 
 
 
191 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  47.51 
 
 
197 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  45.95 
 
 
202 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  47.22 
 
 
191 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  47.56 
 
 
204 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  40.66 
 
 
212 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  48.62 
 
 
191 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  48.9 
 
 
189 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  40 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  43.96 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  41.11 
 
 
205 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  39.78 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  41.21 
 
 
211 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  39.44 
 
 
193 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1133  chemotaxis-specific methylesterase  41.05 
 
 
365 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  40.66 
 
 
194 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.21 
 
 
371 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.13 
 
 
419 aa  134  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2688  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.33 
 
 
350 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000112566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.77 
 
 
353 aa  131  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0648  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.53 
 
 
341 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0639  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.53 
 
 
341 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  40.11 
 
 
362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
364 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.92 
 
 
385 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.81 
 
 
358 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 
347 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  39.78 
 
 
334 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.89 
 
 
365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2418  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.57 
 
 
355 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.033  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  38.46 
 
 
327 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0658  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.21 
 
 
340 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  41.44 
 
 
351 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  39.23 
 
 
344 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.77 
 
 
386 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1145  protein-glutamate methylesterase  38.46 
 
 
354 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00201495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  37.29 
 
 
345 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0465  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.71 
 
 
356 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.66 
 
 
341 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2028  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.76 
 
 
356 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  39.01 
 
 
347 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  37.36 
 
 
329 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0301  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.97 
 
 
360 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.424867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0601  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40 
 
 
344 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.64 
 
 
352 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6730  chemotaxis response regulator protein CheB-glutamate methylesterase  39.89 
 
 
364 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.324062  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0943  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.33 
 
 
354 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0209  chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase  38.59 
 
 
354 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  38.25 
 
 
338 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.01 
 
 
356 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  37.78 
 
 
349 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  41.81 
 
 
349 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0791  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.55 
 
 
367 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1150  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.08 
 
 
367 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149663  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0765  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.55 
 
 
367 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2711  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  36.02 
 
 
347 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16480  chemotaxis-specific methylesterase  37.7 
 
 
335 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00306037  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2969  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
367 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  39.23 
 
 
337 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04755  chemotaxis-specific methylesterase  39.68 
 
 
379 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  37.16 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2982  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.37 
 
 
355 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2104  response regulator receiver domain-containing protein  37.63 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  35.71 
 
 
387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0161  protein-glutamate methylesterase CheB  38.59 
 
 
395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1435  chemotaxis-specific methylesterase  37.17 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0618  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.66 
 
 
371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2635  CheB methylesterase  37.02 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.177706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  39.63 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7044  CheB methylesterase  36.61 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703478  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  36.56 
 
 
339 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.37 
 
 
370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  39.88 
 
 
364 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0140  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.78 
 
 
363 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0124  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 
362 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.16 
 
 
361 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1406  two component CheB methylesterase  39.08 
 
 
363 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.890909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1730  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.51 
 
 
354 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>