More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1133 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1133  CheB methylesterase  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00605685  normal  0.0981468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1032  CheB methylesterase  41.88 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4245  Protein-glutamate methylesterase  38.61 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0390  CheB methylesterase  36.11 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  0.342952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0628  CheB methylesterase  32.98 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4782  CheB methylesterase  36.47 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0649  CheB methylesterase  32.46 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.350162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3994  CheB methylesterase  35.5 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.645051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2803  CheB methylesterase  33.9 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2259  CheB methylesterase  32.14 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.396327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3337  CheB methylesterase  34.81 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3351  CheB methylesterase  31.25 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1071  CheB methylesterase  29.95 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.580355  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2648  CheB methylesterase  32.75 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3721  CheB-type protein glutamate methylesterase  32.22 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3829  CheB methylesterase  32.22 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153507  normal  0.0823078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3784  CheB methylesterase  30.59 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9099  protein-glutamate methylesterase  34.66 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0607  CheB methylesterase  32.61 
 
 		 328 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5355  CheB methylesterase  32.32 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.85514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5236  CheB methylesterase  28.18 
 
 		 334 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0578478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2714  protein-glutamate methylesterase, putative  30.63 
 
 		 204 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.485879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2589  CheB methylesterase  30 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3103  CheB methylesterase  30.3 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0171  CheB methylesterase  32.76 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1299  CheB methylesterase  30.6 
 
 		 354 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5265  CheB methylesterase  31.41 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2078  protein-glutamate methylesterase (chemotaxis-specific methylesterase)  30.95 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.145909  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1646  protein-glutamate methylesterase  29.67 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2447  protein-glutamate methylesterase  29.38 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000959912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1739  CheB methylesterase  31.68 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1218  CheB methylesterase  31.55 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886887  normal  0.756403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3120  CheB methylesterase  27.33 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.653439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0020  CheB methylesterase  25.97 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4208  CheB methylesterase  27.81 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3119  CheB methylesterase  26.92 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.065786  normal  0.711094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5570  CheB methylesterase  28.57 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5388  CheB methylesterase  31.87 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636492  normal  0.0826841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3759  CheB methylesterase  28.57 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5253  CheB methylesterase  29.76 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2004  CheB methylesterase  28.57 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0432  CheB methylesterase  28.75 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2144  CheB methylesterase  28.99 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4423  CheB methylesterase  27.98 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2108  CheB methylesterase  29.38 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1189  CheB methylesterase  27.06 
 
 		 338 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 1165 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4782  CheB methylesterase  29.89 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2640  CheB methylesterase  28.67 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887817  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2078  CheB methylesterase  29.76 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1963  CheB methylesterase  28.57 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00795187  normal  0.0718723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3206  CheB methylesterase  28.16 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5775  CheB methylesterase  26.59 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  0.0114138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5177  CheB methylesterase  30.25 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.157915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1840  MCP methyltransferase, CheR-type  26.54 
 
 		 840 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3128  MCP methyltransferase, CheR-type  26.54 
 
 		 840 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.95 
 
 		 1361 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3756  CheB methylesterase  26.23 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  26.42 
 
 		 1170 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  26.42 
 
 		 1170 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3836  CheB methylesterase  27.33 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6263  CheB methylesterase  26.78 
 
 		 340 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  29.48 
 
 		 998 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  27.95 
 
 		 1149 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  28.3 
 
 		 617 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3192  CheB methylesterase  26.92 
 
 		 334 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.187695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6210  CheB methylesterase  28.18 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0111856  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0952  CheB methylesterase  23.7 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.421846  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.5 
 
 		 993 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.33 
 
 		 1158 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.32 
 
 		 1274 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  27.17 
 
 		 1384 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  26.71 
 
 		 887 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.86 
 
 		 1418 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  26.22 
 
 		 879 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  24.18 
 
 		 856 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 1222 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  26.88 
 
 		 1200 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.88 
 
 		 971 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2040  CheB methylesterase  25.31 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1611  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.89 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.67 
 
 		 1535 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5191  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  28.3 
 
 		 813 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.29 
 
 		 1445 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16480  chemotaxis-specific methylesterase  27.06 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00306037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  25.67 
 
 		 1167 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.42 
 
 		 1233 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6398  CheB methylesterase  28.93 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3556  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.48 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1435  chemotaxis-specific methylesterase  27.06 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  25.52 
 
 		 868 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  27.44 
 
 		 387 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 1279 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  27.17 
 
 		 385 aa  58.2  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0614  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  26.63 
 
 		 341 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00621124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  25.93 
 
 		 852 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1098  chemotaxis-specific methylesterase  24.84 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1057  chemotaxis-specific methylesterase  25 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3575  CheB methylesterase  26.47 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  24.35 
 
 		 1618 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>