265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9057 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  98.53 
 
 		 230 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  42.65 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  44.61 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  41.58 
 
 		 244 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  42.08 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  41.41 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  42.93 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  43.81 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  38.24 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  39.7 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  40.86 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  41.63 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  45.79 
 
 		 251 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  44.72 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  32.19 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.52 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  36.73 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  32.68 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  104  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.17 
 
 		 256 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  32.49 
 
 		 350 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  31.98 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  30.04 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.64 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  35.68 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  31.86 
 
 		 313 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.8 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  31.19 
 
 		 288 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  33.17 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  32.37 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  33.15 
 
 		 261 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  28.82 
 
 		 305 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  29.18 
 
 		 282 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  27.9 
 
 		 308 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  31.34 
 
 		 303 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  29.78 
 
 		 312 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.92 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  33.68 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  39.46 
 
 		 292 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  30.65 
 
 		 321 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.73 
 
 		 303 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  33.52 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  29.85 
 
 		 293 aa  95.1  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  30.73 
 
 		 256 aa  94.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  31.28 
 
 		 296 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  34.27 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  32.76 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.47 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  29.85 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  33.52 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  31.03 
 
 		 284 aa  91.7  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  91.3  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  35.09 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  34.5 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  33.01 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  29.61 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  28.82 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.35 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.09 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.42 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.44 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  32.09 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.61 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  31.1 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 		 281 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  35.47 
 
 		 289 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  29.59 
 
 		 303 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  30.62 
 
 		 246 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  28.44 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  28.44 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  30.46 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  28.69 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  32.79 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  30.21 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  30.59 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  30.59 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  41.67 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  27.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  30.59 
 
 		 290 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  30.93 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  33.14 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  29.47 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  32.64 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  26.87 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  28.83 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  36.89 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  31.03 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  29.09 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  29.65 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  30.59 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  36.21 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>