290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5035 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  63.91 
 
 		 305 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  66.55 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  60.93 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  60.6 
 
 		 305 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  60.4 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  60.42 
 
 		 286 aa  363  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  60.63 
 
 		 301 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  59.21 
 
 		 312 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  58.84 
 
 		 321 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  55.97 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  59.17 
 
 		 293 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  54.64 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  56.25 
 
 		 303 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  55.4 
 
 		 340 aa  330  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  54.79 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  55.56 
 
 		 289 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  53.63 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  53.77 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  53.77 
 
 		 322 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  54.48 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  56.99 
 
 		 303 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  53.42 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  53.42 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  53.08 
 
 		 303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  51.56 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  50.68 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  51.49 
 
 		 288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  47.06 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  43.84 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  45.61 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  43.55 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  42.52 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  44.91 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  43 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  42.81 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  42.25 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  41.24 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  42.01 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  41.05 
 
 		 267 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  40.56 
 
 		 267 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  41.4 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  40.35 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  42.28 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  40.99 
 
 		 268 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  41.46 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  39.86 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  40.35 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  40.56 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  41.03 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  39.65 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  40.62 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  42.24 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  40.85 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  40.7 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  42.18 
 
 		 259 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  39.93 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  39.16 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  39.72 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  38.33 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  39.16 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  38.03 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  37.01 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  34.36 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  35.42 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  36.24 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  36.24 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  34.27 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  34.62 
 
 		 243 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  34.03 
 
 		 251 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 		 247 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.1 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  37.3 
 
 		 270 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  33.69 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.9 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  29.79 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  31.91 
 
 		 243 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  35.56 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.69 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  32.79 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  123  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  28.67 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  30.18 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  29.89 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  30.5 
 
 		 249 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  29.45 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  30.18 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.39 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  29.33 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  34.6 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  28.77 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  32.77 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  29.02 
 
 		 241 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  29.58 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  30.18 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>