296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4197 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  97.41 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  64.14 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  65.22 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  44.3 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  43.78 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  43.78 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  43.22 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  40 
 
 		 243 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  37.22 
 
 		 313 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  38.63 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  39.32 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  34.75 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  38.02 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  39.08 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  39 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  36.97 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  35.48 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  32.38 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  39.66 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  34.38 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  34.17 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  33.71 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  32.63 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  39.08 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  32.35 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  36.82 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  32.41 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  37.35 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  39.92 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  35.02 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  35.86 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  35.56 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  34.19 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  37.5 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  32.4 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  39.5 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  37.39 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  32.41 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  36.55 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  35.42 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  35.68 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  38.1 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  31.82 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  33.57 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  33.45 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  32.01 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  32.78 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  34.03 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  36.32 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  35.83 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  32.99 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  32.99 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  32.99 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  37.08 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  35.04 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  32.51 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.91 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  31.65 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  31.03 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  34.84 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.03 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  34.78 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  33.61 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.75 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  30.71 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  33.61 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  34.43 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  32.37 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  35.27 
 
 		 218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  30.62 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  32.49 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  33.21 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  32.04 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  34.31 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  29.89 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  32.17 
 
 		 350 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  30.18 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  31.54 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  31.07 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  31.64 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  30.22 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  34.56 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  32.23 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  29.57 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  30.21 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  28.41 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  31.22 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  36.71 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  27.91 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  30.54 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  33.21 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  30.08 
 
 		 387 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>