278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4101 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  97.41 
 
 		 251 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  61.23 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  62.73 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  42.15 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  43.56 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  43.56 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  40.81 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  35.11 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  37.1 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  36.53 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  36.53 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  33.84 
 
 		 318 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  37 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  34.06 
 
 		 261 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  35.4 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.53 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  34.23 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  33.78 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  34.39 
 
 		 282 aa  124  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  31.25 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  37.56 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  32.4 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  32.58 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  34.53 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  35.84 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  38.46 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  32.73 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  37.96 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  30.66 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  34.82 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  34.82 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.13 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  33.18 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  38.01 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  30.7 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  34.09 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  31.09 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  32.29 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  35.68 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  36.41 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  33.93 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  30.45 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 		 321 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  30.51 
 
 		 322 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  30.51 
 
 		 336 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  31.22 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  30.3 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  31.82 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  35.05 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  33.63 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  31.25 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  32.13 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.7 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.7 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.7 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  31.39 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  30.51 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  29.2 
 
 		 312 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  35.43 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  30.19 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.77 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  30.55 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  30.74 
 
 		 305 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  31.68 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.42 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  28.85 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  31.11 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  31.44 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  28.69 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  30.57 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  31.28 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  30.42 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.02 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.36 
 
 		 271 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  28.41 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  28.16 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  32.16 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  31.08 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  29.43 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  28.16 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  34.2 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  29.78 
 
 		 305 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  30.96 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  28.41 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  28.76 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  30.37 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  30.35 
 
 		 264 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  26.94 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  32.47 
 
 		 282 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  30.46 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>