291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2164 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  77.73 
 
 
243 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  72.69 
 
 
242 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  66.81 
 
 
241 aa  346  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  73.95 
 
 
247 aa  346  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  71.01 
 
 
241 aa  338  4e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  65.97 
 
 
244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  65.97 
 
 
244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  65.97 
 
 
244 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  65.11 
 
 
246 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  63.98 
 
 
242 aa  294  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  45.38 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  46.03 
 
 
254 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  46.64 
 
 
242 aa  200  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  47.08 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  44.3 
 
 
245 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  44.3 
 
 
245 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  45.42 
 
 
243 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  45.38 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  41.15 
 
 
256 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  39.33 
 
 
248 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  40.95 
 
 
271 aa  165  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  34.17 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  36.21 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  36.25 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  46.52 
 
 
279 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  45.96 
 
 
256 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  34.03 
 
 
237 aa  159  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  46.55 
 
 
261 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  45.87 
 
 
254 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  40.42 
 
 
241 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  32.77 
 
 
242 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  40.51 
 
 
243 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  37.55 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  41.3 
 
 
264 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  37.82 
 
 
293 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.93 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  36.55 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  35.98 
 
 
244 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  36 
 
 
242 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  42.02 
 
 
249 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  36.26 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.41 
 
 
244 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  36 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  42.02 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  40.26 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  36.13 
 
 
251 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  41.18 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  35.98 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  34.04 
 
 
305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  34.7 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  38.56 
 
 
246 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  35.11 
 
 
321 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  38.14 
 
 
244 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  29.96 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  36.67 
 
 
282 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  34.04 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  31.93 
 
 
301 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  32.86 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.72 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  35.66 
 
 
281 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  31.72 
 
 
303 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  33.73 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  35.17 
 
 
387 aa  126  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  31.3 
 
 
267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  34.29 
 
 
340 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.4 
 
 
256 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  34 
 
 
256 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  32.62 
 
 
305 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  32.75 
 
 
289 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  31.97 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  31.8 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  31.15 
 
 
272 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  33.94 
 
 
322 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  30.63 
 
 
293 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  33.93 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  34.04 
 
 
296 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  31.8 
 
 
295 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  32.99 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  32.82 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  33.21 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  31.89 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.96 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  31.54 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  31.68 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  32.04 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  30.99 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  32.04 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  32.04 
 
 
303 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  30.96 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  30.64 
 
 
251 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 
268 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  30.71 
 
 
280 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  28.91 
 
 
261 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  31.01 
 
 
268 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  28.91 
 
 
261 aa  109  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  43.97 
 
 
166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>