270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1234 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  67.8 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  67.94 
 
 		 267 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  67.42 
 
 		 268 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  64.42 
 
 		 268 aa  359  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  60 
 
 		 267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  61.6 
 
 		 274 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  59.55 
 
 		 267 aa  334  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  59.32 
 
 		 267 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  60.53 
 
 		 268 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  58.56 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  58.11 
 
 		 267 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  57.47 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  54.41 
 
 		 265 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  51.89 
 
 		 264 aa  291  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  53.46 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  53.26 
 
 		 273 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  51.92 
 
 		 279 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  52.29 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  50.57 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  46.59 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  52.69 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  51.6 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  52 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  46.97 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  51.14 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  49.19 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  47.92 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  43.25 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  43.82 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  43.98 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  42.03 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  39.1 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  46.3 
 
 		 252 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  37.24 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  38.25 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  40.56 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  37.54 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  37.41 
 
 		 312 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  35.92 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  38.43 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  35.92 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  37.24 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  36.81 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  37.46 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  37.89 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  37.24 
 
 		 336 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  35.42 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  38.6 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  37.1 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  36.64 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  36.64 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  36.64 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  36.86 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  38.01 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  35.46 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  39.31 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  32.65 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  33.61 
 
 		 282 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  38.89 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  32.49 
 
 		 313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  34.57 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  33.59 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  36.32 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.24 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.24 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.94 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  33.18 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  29.01 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.3 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.15 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.92 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.62 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.54 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  34.98 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.59 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  33.94 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  33.49 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  34.08 
 
 		 244 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  31.66 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  30.12 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  31.07 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  34.25 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.02 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.02 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.02 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  28.97 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  28.5 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  34.93 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  31.1 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  26.82 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  32.71 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.25 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  28.35 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  31.72 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>