More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3824 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  73.95 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  70.12 
 
 		 243 aa  340  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  66.8 
 
 		 242 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  70.82 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  63.07 
 
 		 241 aa  336  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  60.42 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  59.35 
 
 		 246 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  58.85 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  58.85 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  58.44 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  42.26 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  42.28 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  44.59 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  40.51 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  40.51 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  43.93 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  47.83 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  41.35 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.06 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.82 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  38.49 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  39.66 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  38.36 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  37.17 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  43.33 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  41.99 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  41.77 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  41.33 
 
 		 271 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  35.44 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  35.71 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  42.08 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  42.92 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  41.88 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  36.17 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  31.93 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  34.73 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  36.48 
 
 		 387 aa  138  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  36.32 
 
 		 251 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  30.8 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  40.24 
 
 		 279 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  32.26 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  43.24 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  42.16 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  34.35 
 
 		 321 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  42.7 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  34.8 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  33.06 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  35.93 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  37.09 
 
 		 282 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  41.15 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  31.83 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  36.06 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  37.08 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  32.06 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  35.58 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  29.79 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  32.52 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  32.78 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  33.58 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  32.42 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  34.23 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  31.66 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  34.09 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  34.8 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  30.88 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  32.13 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  33.94 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  33.18 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  39.29 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  35.48 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  33.03 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.07 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  31.42 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  33.64 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  33.64 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  30.18 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  30.42 
 
 		 305 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  29.79 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  31.58 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  33.03 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  33.09 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  31.17 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.14 
 
 		 312 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  32.16 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  30.6 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  30.98 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  31.12 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  31.21 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  32.11 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  31.34 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  32.72 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  32.98 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  28.78 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  31.08 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>