287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2282 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  57.38 
 
 
251 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  55.08 
 
 
242 aa  254  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  46.19 
 
 
243 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  45.8 
 
 
243 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  47.16 
 
 
264 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  44.73 
 
 
249 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  43.64 
 
 
242 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  42.68 
 
 
247 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  43.04 
 
 
246 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  42.86 
 
 
242 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  44.3 
 
 
240 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  42.37 
 
 
244 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  42.15 
 
 
243 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  39.83 
 
 
237 aa  187  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  43.78 
 
 
251 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  41.1 
 
 
244 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  43.98 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  45.34 
 
 
241 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  44.49 
 
 
256 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  39.08 
 
 
241 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  42.8 
 
 
249 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  40.51 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  38.91 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  42.8 
 
 
249 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  44.77 
 
 
246 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  42.54 
 
 
261 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  40.96 
 
 
313 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  39.24 
 
 
244 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  39.24 
 
 
244 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  43.38 
 
 
244 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  38.99 
 
 
282 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  42.73 
 
 
244 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  42.37 
 
 
249 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  37.13 
 
 
242 aa  168  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  39.24 
 
 
244 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  38.3 
 
 
286 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  39.83 
 
 
241 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  37.24 
 
 
242 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  43.8 
 
 
254 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  43.56 
 
 
234 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  42.36 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  38.35 
 
 
277 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  36.04 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  36.92 
 
 
340 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  35.21 
 
 
301 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  38.43 
 
 
281 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  38.43 
 
 
246 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  40.61 
 
 
254 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  34.26 
 
 
305 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  35.74 
 
 
248 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  33.88 
 
 
252 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  36.59 
 
 
321 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  37.22 
 
 
293 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  35.59 
 
 
247 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  36.24 
 
 
308 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  36.98 
 
 
303 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  34.84 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  34.6 
 
 
305 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  36.4 
 
 
251 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  34.26 
 
 
350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  35.56 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  42.37 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  38.24 
 
 
293 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  35.19 
 
 
295 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  33.9 
 
 
322 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  36.8 
 
 
281 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  33.9 
 
 
336 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  35.71 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  38.71 
 
 
271 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  35.85 
 
 
303 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  37.08 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  36.69 
 
 
296 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  37.86 
 
 
387 aa  146  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  32.54 
 
 
325 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  32.76 
 
 
303 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  32.76 
 
 
303 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  32.76 
 
 
303 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  33.57 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  35.24 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  36.67 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  34.64 
 
 
303 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  32.52 
 
 
312 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  35.83 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  35.55 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  34.18 
 
 
288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  33.46 
 
 
261 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  35.43 
 
 
248 aa  132  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  31.78 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  33.05 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  33.85 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  40.85 
 
 
242 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  34.12 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  35.85 
 
 
290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  33.81 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  37.44 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  36.97 
 
 
269 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.35 
 
 
249 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  34.43 
 
 
272 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>