295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4328 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  83.83 
 
 
303 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  70 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  63.3 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  64.95 
 
 
318 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  58.84 
 
 
321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  56.18 
 
 
340 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  56.25 
 
 
308 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  57.09 
 
 
289 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  54.04 
 
 
305 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  55.44 
 
 
286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  54.15 
 
 
312 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  55.89 
 
 
296 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  55.44 
 
 
295 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  54.2 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  54.58 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  53.26 
 
 
303 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  52.8 
 
 
350 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  51.85 
 
 
325 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  52.7 
 
 
308 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  51.15 
 
 
322 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  51.49 
 
 
336 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  50.49 
 
 
303 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  50.49 
 
 
303 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  50.49 
 
 
303 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  51.35 
 
 
277 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  53.33 
 
 
288 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  51.71 
 
 
282 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  49.3 
 
 
313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  45.3 
 
 
264 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  45.7 
 
 
281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  44.14 
 
 
268 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  43.66 
 
 
309 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  46.34 
 
 
264 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  43.94 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  43.75 
 
 
273 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  44.29 
 
 
272 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  43.94 
 
 
267 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  42.12 
 
 
267 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  43.99 
 
 
267 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  46.47 
 
 
259 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  45.72 
 
 
269 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  42.21 
 
 
282 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  40.69 
 
 
268 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  46.92 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  43.16 
 
 
279 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  39.86 
 
 
268 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  43 
 
 
267 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  42.8 
 
 
290 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  39.18 
 
 
268 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  44.56 
 
 
259 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  39.45 
 
 
267 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  42.16 
 
 
248 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  40.7 
 
 
274 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  41.05 
 
 
265 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  37.24 
 
 
267 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  38.54 
 
 
316 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  41.75 
 
 
254 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  39.93 
 
 
265 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  41.4 
 
 
259 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  41.67 
 
 
254 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  38.33 
 
 
261 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  41.04 
 
 
268 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  40.14 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  39.19 
 
 
256 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  35.86 
 
 
243 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  37.27 
 
 
241 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  35.38 
 
 
264 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  36.74 
 
 
270 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  36.98 
 
 
245 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  35.07 
 
 
249 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  36.98 
 
 
245 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  35.58 
 
 
251 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  34.29 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  33.22 
 
 
244 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  32.17 
 
 
244 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.49 
 
 
242 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  34.2 
 
 
242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  34.8 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  33.83 
 
 
243 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  31.01 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  34.59 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  34.23 
 
 
249 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.41 
 
 
251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  36.91 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.94 
 
 
243 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  31.72 
 
 
242 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.22 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 
247 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  32.71 
 
 
246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.73 
 
 
271 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.88 
 
 
244 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  34.83 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.72 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.39 
 
 
244 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.33 
 
 
246 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  28.09 
 
 
237 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  29.58 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  35.59 
 
 
246 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  33.91 
 
 
242 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>