More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0078 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
241 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  68.46 
 
 
243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  65.98 
 
 
242 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  66.81 
 
 
240 aa  346  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  63.07 
 
 
247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  60.83 
 
 
241 aa  322  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  56.9 
 
 
244 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  56.9 
 
 
244 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  57.38 
 
 
242 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  56.9 
 
 
244 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  55.6 
 
 
246 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  43.75 
 
 
251 aa  208  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  41.98 
 
 
254 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  41.6 
 
 
242 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  41 
 
 
243 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  39.08 
 
 
245 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  39.08 
 
 
245 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  35.8 
 
 
247 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  38.59 
 
 
248 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.68 
 
 
256 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  40.59 
 
 
249 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  39.75 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  37.97 
 
 
244 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  38.98 
 
 
244 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  37.29 
 
 
218 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  37.66 
 
 
293 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
252 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  34.45 
 
 
237 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  36.82 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  35.32 
 
 
313 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  35.27 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  34.85 
 
 
242 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  32.64 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  40.34 
 
 
261 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  38.08 
 
 
249 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  38.08 
 
 
249 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  39.26 
 
 
279 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  35.81 
 
 
271 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  34.3 
 
 
240 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  39.5 
 
 
256 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  37.13 
 
 
251 aa  141  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  35.42 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  37.66 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  38.36 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  34.84 
 
 
387 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 
254 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  31.6 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  34.2 
 
 
281 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  30.22 
 
 
303 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  29.72 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  33.94 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.96 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  31.07 
 
 
340 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  32.11 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  30.27 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  29.89 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  31 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  30.92 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  31.3 
 
 
268 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  30.65 
 
 
264 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  30.31 
 
 
321 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  31.3 
 
 
267 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.66 
 
 
256 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  29.31 
 
 
289 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  28.73 
 
 
303 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  30.28 
 
 
305 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  30.34 
 
 
303 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  30.15 
 
 
267 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  31.87 
 
 
286 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  29.84 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  30.29 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  33.2 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  32.37 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  29.89 
 
 
263 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  30.3 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  34.53 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  33.93 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  29.62 
 
 
350 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  30.13 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  29.26 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  30.13 
 
 
259 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  29.96 
 
 
265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  31.31 
 
 
269 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  30.74 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  29.29 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  29.17 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  29.31 
 
 
336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  28.74 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  31.71 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  29.02 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  29.66 
 
 
322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  29.45 
 
 
288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  29.07 
 
 
282 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  29.92 
 
 
268 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  33.61 
 
 
242 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  30.7 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  28.97 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  28.97 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>