264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2198 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  64.37 
 
 
265 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  55.09 
 
 
265 aa  304  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  57.36 
 
 
264 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  56.42 
 
 
267 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  55.08 
 
 
268 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  54.83 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  53.46 
 
 
267 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  54.62 
 
 
264 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  53.67 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  54.47 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  52.47 
 
 
267 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  53.64 
 
 
267 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  56.68 
 
 
259 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  53.26 
 
 
316 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  56.68 
 
 
269 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  58.7 
 
 
252 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  52.69 
 
 
267 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  53.1 
 
 
272 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  54.3 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  51.74 
 
 
274 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  51.54 
 
 
273 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  51.54 
 
 
279 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  50.96 
 
 
268 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  51.23 
 
 
261 aa  261  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  50.58 
 
 
268 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  50.77 
 
 
282 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  51.23 
 
 
259 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  51.23 
 
 
254 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  49.81 
 
 
268 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  50 
 
 
290 aa  254  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  49.23 
 
 
268 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  48.59 
 
 
293 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  43.21 
 
 
303 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  42.16 
 
 
303 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  42.25 
 
 
318 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  45.86 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  42.4 
 
 
301 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  41.64 
 
 
286 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  39.16 
 
 
308 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  39.57 
 
 
340 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  39.02 
 
 
295 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  40.56 
 
 
325 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  39.58 
 
 
312 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  40.49 
 
 
296 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  37.68 
 
 
305 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  38.35 
 
 
313 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  40.15 
 
 
312 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  36.97 
 
 
350 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  39.16 
 
 
336 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  39.16 
 
 
322 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  37.98 
 
 
321 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  38.81 
 
 
303 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  38.81 
 
 
303 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  38.81 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  35.76 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  38.46 
 
 
289 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 
308 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  38.87 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  41.03 
 
 
270 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  37.82 
 
 
281 aa  168  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  36.55 
 
 
303 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  36.76 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  36.67 
 
 
281 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  37.68 
 
 
288 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  39.3 
 
 
203 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  31.33 
 
 
256 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  33.19 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.43 
 
 
245 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.43 
 
 
245 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  33.47 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  32.79 
 
 
251 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  32.11 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  33.87 
 
 
246 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  32.38 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  32.35 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.71 
 
 
243 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.97 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.65 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.38 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  31.82 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.58 
 
 
252 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.06 
 
 
243 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  32.13 
 
 
247 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  34.36 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 
247 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.92 
 
 
249 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.75 
 
 
271 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.43 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  34.43 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.43 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.43 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.65 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.69 
 
 
246 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.78 
 
 
247 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  35.6 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  34.36 
 
 
279 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  27.64 
 
 
244 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  32.34 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.46 
 
 
244 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>