More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1153 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.61 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  40.95 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  39.36 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  40.97 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  37.55 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  38.71 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  38.71 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  33.6 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  35.29 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  34.7 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  34.94 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  38.78 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  41.8 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  36.82 
 
 		 242 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  41.33 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  35.9 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.17 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  35.81 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  44.44 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  34.84 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  39.56 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  35.46 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  43.33 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  43.89 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  38.49 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  34.55 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  33.45 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  37.93 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  36.51 
 
 		 244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  36.51 
 
 		 244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  32.46 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  36.51 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  32.24 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  36.12 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  31.68 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  33.47 
 
 		 387 aa  131  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  32.99 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  34.57 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.79 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  31.4 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  33.45 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  32.09 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  32.03 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  32.46 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  41.44 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  32.93 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  31.73 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  32.75 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.73 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  34.81 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  32.06 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  32.23 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  32.02 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  35.25 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.88 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  33.2 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  33.59 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  36.86 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  31.47 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  31.08 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  30.3 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  40.22 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  37.72 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  31.1 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  32.34 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  31.08 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  32.85 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  30.85 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  34.1 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  33.2 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  31.14 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  31.02 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  34.08 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  29.45 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  31.49 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  32.31 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  35.78 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  32.45 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  30.42 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  30.27 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  29.21 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  34.13 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.52 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.3 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  30.94 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  30.4 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  32 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  44.37 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  29.53 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  32.75 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  34.25 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  33.47 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.85 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  39.88 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  38.04 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  30.68 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>