276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3482 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  99.37 
 
 
317 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  98.42 
 
 
317 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  98.74 
 
 
317 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  78.19 
 
 
298 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  70.35 
 
 
316 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  70.35 
 
 
316 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  70.66 
 
 
317 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  82.46 
 
 
245 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  60.76 
 
 
301 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  55.76 
 
 
288 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  53 
 
 
289 aa  328  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  55.13 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  56.09 
 
 
277 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  46.44 
 
 
272 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  46.44 
 
 
272 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  46.44 
 
 
272 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  46.44 
 
 
272 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  46.44 
 
 
272 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  45.45 
 
 
271 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  46.91 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  49.24 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  46.91 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  46.91 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  44.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  44.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  44.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  44.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  44.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  44.75 
 
 
272 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  44.41 
 
 
272 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  44.41 
 
 
272 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  44.89 
 
 
277 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  45.39 
 
 
271 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  45.09 
 
 
270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  43.12 
 
 
270 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  41.16 
 
 
280 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  43.91 
 
 
270 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  43.48 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  40.4 
 
 
289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  41 
 
 
289 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  42.86 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  40.56 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  39.34 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  41.16 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  39.37 
 
 
289 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  38.89 
 
 
289 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  38.89 
 
 
289 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  40.29 
 
 
283 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  38.78 
 
 
275 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  39.07 
 
 
275 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  37.2 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  38.61 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  38.21 
 
 
288 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  37.68 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  39.64 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  38.38 
 
 
283 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  35.92 
 
 
292 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  38.74 
 
 
286 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  36.14 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  36.36 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  32.01 
 
 
284 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  34.53 
 
 
284 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  35.87 
 
 
283 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  32.34 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.47 
 
 
271 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.6 
 
 
299 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  26.05 
 
 
314 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  26.57 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  23.61 
 
 
303 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  26.71 
 
 
243 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  23.05 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.96 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.96 
 
 
241 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.33 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  35.56 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  27.82 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  32.97 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.25 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.52 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.25 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  36.75 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  24.56 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  24.56 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  30.91 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  24.56 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.62 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  26.14 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.7 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  32.64 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  31.47 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  33.1 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  29.34 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  25.37 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  34.81 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  28.77 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>