250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1455 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  95.83 
 
 
288 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  67.71 
 
 
289 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  68.75 
 
 
287 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  68.42 
 
 
289 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  67.37 
 
 
289 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  67.37 
 
 
289 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  67.37 
 
 
289 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  66.9 
 
 
286 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  62.72 
 
 
289 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  67.68 
 
 
284 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  43.32 
 
 
288 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  46.07 
 
 
271 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  46.07 
 
 
271 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  46.07 
 
 
271 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  41.67 
 
 
289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  40.77 
 
 
292 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  42.26 
 
 
277 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  44.61 
 
 
275 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  44.24 
 
 
280 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  43.66 
 
 
276 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  38.61 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  42.34 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  44.49 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  42.28 
 
 
272 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  38.61 
 
 
317 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  43.07 
 
 
272 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  38.28 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  42.28 
 
 
272 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  42.28 
 
 
272 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  42.28 
 
 
272 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  42.28 
 
 
272 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  42.28 
 
 
272 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  37.95 
 
 
317 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  41.91 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  37.54 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  40.15 
 
 
298 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  45.27 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  45.27 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  45.27 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  45.27 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  45.27 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  41.57 
 
 
275 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  39.18 
 
 
316 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  39.58 
 
 
293 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  41.54 
 
 
272 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  40.75 
 
 
301 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  41.48 
 
 
270 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  38.6 
 
 
284 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  39.51 
 
 
293 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  38.66 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  40.52 
 
 
317 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  42.07 
 
 
271 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  41.43 
 
 
275 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  39.65 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  41.11 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  41.52 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  40.91 
 
 
290 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  39.05 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  40.21 
 
 
284 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  39.52 
 
 
277 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  42.38 
 
 
245 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  35.96 
 
 
287 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  35.34 
 
 
283 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  27.46 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  41.57 
 
 
271 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  30.86 
 
 
299 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.84 
 
 
252 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  28.12 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  26.62 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  37.41 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  37.66 
 
 
218 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  28.63 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  32.05 
 
 
237 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  26.97 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  33.12 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  33.56 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  28.95 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  35.48 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.09 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  32.19 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.29 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  28.44 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  35.71 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.71 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.11 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  33.73 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  34.97 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.01 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  39.29 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  34.25 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  29.07 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  28.08 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  38.57 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>