234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1194 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  88.36 
 
 		 275 aa  484  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  75.27 
 
 		 283 aa  427  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  72 
 
 		 283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  68.36 
 
 		 275 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  63.77 
 
 		 276 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  60.93 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  37.2 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  37.2 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  37.2 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  37.2 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  38.01 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  41.95 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  37.97 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  41.57 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  38.26 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  37.88 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  36.1 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  42.35 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  39.77 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  39.39 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  38.62 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  39.58 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  38.4 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  38.87 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.91 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  39.92 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  38.64 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  38.26 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  35.61 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  38.17 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  36.88 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  38.08 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  35.79 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  35.74 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  35.74 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  36.5 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  35.74 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  36.13 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  36.13 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  35.06 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  36.88 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  36.5 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  35.36 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  33.59 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  38.54 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  32.85 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  34.6 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  35.09 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  34.21 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  34.2 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  34.53 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  34.51 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  29.26 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  28.62 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  30.15 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.67 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  24.9 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  24.37 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  25.78 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  29.84 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  25.66 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  28.23 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  38.97 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  36.96 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  36.03 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.07 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.11 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  35.77 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  35.51 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  24.8 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  34.06 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.26 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  37.06 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  36.11 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  32.61 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.07 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  36.43 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.07 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  25.55 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  29.85 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  34.25 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  36.62 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  33.73 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.54 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  28.52 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  38.89 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  28.9 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25.9 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>