259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3355 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  67.36 
 
 		 289 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  65.96 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  67.72 
 
 		 289 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  67.72 
 
 		 289 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  67.37 
 
 		 289 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  64.56 
 
 		 287 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  67.37 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  63.76 
 
 		 288 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  62.72 
 
 		 288 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  67.68 
 
 		 284 aa  359  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  43.6 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  47.06 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  44.65 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  42.03 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  40.73 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  40.4 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  40.4 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  41.81 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  42.47 
 
 		 316 aa  218  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  40.4 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  43.36 
 
 		 316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  38.64 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  42.66 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  43.51 
 
 		 271 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  43.51 
 
 		 271 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  43.57 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  39.1 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  39.51 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  38.38 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  37.14 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  41.16 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  38.81 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  39.71 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  39.35 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  39.71 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  40.2 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  39.35 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  39.79 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  41.06 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  40.07 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  42.28 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  40.07 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  40.07 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  40.07 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  40.07 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  40.07 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  39.92 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  38.25 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  38.66 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  38.66 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  39.92 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  36.67 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  39.92 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  39.78 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  42.11 
 
 		 245 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  39.03 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  38.31 
 
 		 277 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  36.8 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  38.78 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  34.93 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  25.99 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  26.64 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  25.69 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  29.07 
 
 		 271 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  27.76 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  28.62 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  32.37 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  24.81 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.85 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  34.23 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  28.95 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  28.95 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  28.95 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  29.08 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  26.52 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.36 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  35.21 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  34.51 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.71 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  25.95 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  37.17 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  37.17 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  30.43 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  26.72 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  37.04 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  27.31 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  34.04 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  23.26 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  34.84 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.99 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  24.65 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  25.96 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>