238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0604 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  60.76 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  60.13 
 
 		 317 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  60.76 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  60.44 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  63.12 
 
 		 316 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  62.96 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  62.26 
 
 		 288 aa  346  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  58.05 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  63.12 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  61.89 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  59.14 
 
 		 277 aa  324  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  69.52 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  52.52 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  49.2 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  46.93 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  46.93 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  46.93 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  46.82 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  46.93 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  46.93 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  46.82 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  46.82 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  49.19 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  47.58 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  46.77 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  45.09 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  45.09 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  45.09 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  45.09 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  45.09 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  45.09 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  45.86 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  44.73 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  44.73 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  45.02 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  45.45 
 
 		 277 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  44.11 
 
 		 284 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  44.05 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  40.07 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  39.72 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.14 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  39.1 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  40.36 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  40.36 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  39.43 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  37.64 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  41.26 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  41.57 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  40.75 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  38.91 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  35.74 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  40.08 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  38.62 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  37.84 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  39.06 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  38.17 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  34.74 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  33.93 
 
 		 284 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  34.69 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  34.69 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  34.52 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  31.35 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.23 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  24.83 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  25.66 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  24.82 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  24.5 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  27.44 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.35 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  25.51 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  31.72 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  31.37 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  32.52 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  31.47 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  28.65 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.66 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  36.63 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.73 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.12 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.66 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  24.9 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  29.87 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  34.88 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  25.87 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  31.05 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  25.38 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  34.15 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.34 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  27.81 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  35.25 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  22.78 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>