287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3871 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  98.54 
 
 		 249 aa  274  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  57.58 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  55.04 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  57.98 
 
 		 276 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  56.45 
 
 		 254 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  55.47 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  56 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  61.76 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  41.62 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  57.55 
 
 		 256 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  61.61 
 
 		 241 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  45.03 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  44.72 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  44.72 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  44.19 
 
 		 241 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  42.28 
 
 		 244 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  35.82 
 
 		 251 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  42.52 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  43.09 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  37.4 
 
 		 247 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  42.06 
 
 		 244 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  41.59 
 
 		 279 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  36.59 
 
 		 242 aa  88.2  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  38.06 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  38.46 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  38.06 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  42.42 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.58 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  38.26 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  36.36 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  36.94 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  39.1 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  45.13 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  40.91 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  37.21 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  48.86 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  35.83 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  39.6 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  36.64 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  41.51 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  39.13 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  38.13 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  40 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  43.69 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  38.74 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  38.57 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  39.23 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  34.42 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  43.9 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  35.77 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  36.43 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  30.95 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  33.59 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  39.39 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  36.65 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  36.03 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  39.44 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.25 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  32.76 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  39.64 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  32.47 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  35.11 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  26.09 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  37.01 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  36.89 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  36.67 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 		 244 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  36.61 
 
 		 288 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  36.72 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  29.63 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  36 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  34.86 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  38.14 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  37.07 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  36.8 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  35.77 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  30.95 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  34.15 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  34.15 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  29.94 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.77 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  35.66 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  34.48 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  31.01 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  34.15 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  30.99 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>