299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5900 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  516  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  65.06 
 
 
251 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  55.32 
 
 
245 aa  251  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  50.85 
 
 
243 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  51.49 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  51.05 
 
 
244 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  50.43 
 
 
254 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  49.17 
 
 
241 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  54.58 
 
 
249 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  54.07 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  50.63 
 
 
276 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  43.46 
 
 
230 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  47.32 
 
 
241 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  41.63 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  57.55 
 
 
203 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  34.59 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  36.93 
 
 
249 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 
249 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 
249 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  34.91 
 
 
277 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.44 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  32.8 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  36.44 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  37.92 
 
 
279 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  31.35 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  28.69 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  33.47 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  28.69 
 
 
246 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  36.1 
 
 
256 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  34.01 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  34.01 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  34.01 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  30.85 
 
 
350 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 
321 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.76 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  31.33 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  31.17 
 
 
303 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  36.82 
 
 
271 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.76 
 
 
243 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 
281 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  39.39 
 
 
261 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  29.79 
 
 
305 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  29.45 
 
 
308 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  32.66 
 
 
249 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  33.99 
 
 
247 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
256 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.65 
 
 
241 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  31.99 
 
 
296 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  35.6 
 
 
254 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  29.11 
 
 
305 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  33.74 
 
 
243 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  34.36 
 
 
282 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  34.68 
 
 
246 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.93 
 
 
251 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  30.66 
 
 
293 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  39.33 
 
 
244 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  33.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  31.25 
 
 
288 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.2 
 
 
244 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  39.33 
 
 
166 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  32.37 
 
 
243 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  33.03 
 
 
274 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  29.05 
 
 
236 aa  99.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  32.14 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  29.72 
 
 
340 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  28.72 
 
 
295 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  31.65 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  28.67 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  31.08 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  37.64 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  31.33 
 
 
242 aa  95.1  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  30 
 
 
312 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  33.8 
 
 
267 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  32.33 
 
 
264 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  33.18 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.65 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  31.19 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  31.58 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  30.86 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  29.11 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  36.26 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  29.11 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  28.86 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  29.55 
 
 
312 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  27.97 
 
 
242 aa  92  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  37.66 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  29.52 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  36.9 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  31.13 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  33.91 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  32.74 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  36.6 
 
 
247 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  30.66 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  33.8 
 
 
268 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  30.95 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>