291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2967 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  56.67 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  56.72 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  53.25 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  48.74 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  46.86 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  51.35 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  49.38 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  45.19 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  44.21 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  49.13 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  40.6 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  43.44 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  39.7 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  55.47 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.8 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  34.96 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  32.19 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.29 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.84 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  42.24 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.29 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  31.06 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  32.26 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  30.61 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  41.26 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  32.8 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.75 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  32.72 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.11 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  32.1 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  32.1 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  29.63 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  32.1 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.58 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.02 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  31.25 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.25 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  29.67 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  30.23 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  30.71 
 
 		 340 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  29.85 
 
 		 282 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  29.8 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  28.84 
 
 		 303 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  91.7  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  27.71 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.14 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.01 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  28.22 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  28.94 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  34.93 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  29.74 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  31.82 
 
 		 350 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  28.42 
 
 		 312 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  30.49 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  28.81 
 
 		 305 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  28.77 
 
 		 312 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  30.95 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  27.46 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  28.16 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  88.6  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  32.77 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  33.76 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  33.71 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  28.63 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  28.98 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  27.7 
 
 		 318 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  26.05 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  27.42 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  29.55 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  30.08 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  30.83 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.43 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  38.51 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  30.16 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  30.94 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  27.56 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  32.89 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  31.08 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  28.51 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.24 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  32.17 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  31.69 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  28.96 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  35.1 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  35.42 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  35.66 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  32.43 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>