293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0902 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  52.56 
 
 
245 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  48.13 
 
 
244 aa  231  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  49.15 
 
 
243 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  52.81 
 
 
256 aa  228  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  48.98 
 
 
259 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  52.5 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  52.34 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  50.43 
 
 
256 aa  215  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  45.19 
 
 
241 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  45.45 
 
 
276 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  38.2 
 
 
230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  44.44 
 
 
241 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  38.24 
 
 
221 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  56.45 
 
 
203 aa  148  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.61 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  32.26 
 
 
256 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 
246 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.87 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  32.85 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  30.89 
 
 
256 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.35 
 
 
249 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  31.78 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  28.63 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.16 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  32.1 
 
 
303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  33.86 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.47 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  31.45 
 
 
242 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.45 
 
 
241 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.76 
 
 
321 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  32.64 
 
 
244 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  32.64 
 
 
244 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  32.86 
 
 
249 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  32.64 
 
 
244 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  33.86 
 
 
277 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  29.58 
 
 
301 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  31.06 
 
 
254 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.17 
 
 
271 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.33 
 
 
243 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  30.42 
 
 
244 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.03 
 
 
303 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  30.8 
 
 
244 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  30.77 
 
 
242 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.02 
 
 
240 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.13 
 
 
282 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
241 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  30.36 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  29.64 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  31.58 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.66 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  32.02 
 
 
241 aa  96.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  30.71 
 
 
243 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  32.23 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  28.82 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  33.14 
 
 
166 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  31.44 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  28.91 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  30.04 
 
 
308 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  28.24 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  30.54 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  28.99 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  26.59 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  31.05 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  33.87 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.15 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  30 
 
 
267 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  31.62 
 
 
301 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  30.93 
 
 
295 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  32.97 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  30.24 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  35.17 
 
 
292 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  36.62 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  33.05 
 
 
286 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  29.26 
 
 
261 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  28.98 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  28.81 
 
 
293 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  31.55 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  30.14 
 
 
309 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  31.03 
 
 
296 aa  86.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  30.7 
 
 
244 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  27.71 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  31.9 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  31.25 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  30.8 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  27.05 
 
 
312 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  30.88 
 
 
300 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
268 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  28.05 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  26.34 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  29.82 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>