More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1896 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  61.3 
 
 
261 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  54.35 
 
 
256 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  54.55 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  58.5 
 
 
166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  43.78 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  43.09 
 
 
249 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  40.17 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  40.87 
 
 
245 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  39.66 
 
 
241 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  37.19 
 
 
251 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  40.87 
 
 
245 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  42.55 
 
 
242 aa  158  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  40.52 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  35.98 
 
 
247 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  38.43 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  40.16 
 
 
249 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  32.92 
 
 
247 aa  151  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  35.68 
 
 
242 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  40.34 
 
 
249 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  39.26 
 
 
218 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  39.75 
 
 
249 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  36.72 
 
 
256 aa  148  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  40.77 
 
 
246 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  41.35 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  37.93 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  37.86 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  38.17 
 
 
241 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  38.52 
 
 
244 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  38.52 
 
 
244 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  38.52 
 
 
244 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  41.6 
 
 
247 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  32.85 
 
 
277 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  39.92 
 
 
240 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  37.98 
 
 
254 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.99 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  39.08 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  38.24 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  31.13 
 
 
252 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  32.79 
 
 
293 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  34.3 
 
 
251 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  36.12 
 
 
271 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.96 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  30.64 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  43.09 
 
 
242 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  39.57 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  37.97 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  34.98 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.98 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  35.32 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.79 
 
 
237 aa  125  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  31.2 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  30.61 
 
 
318 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  33.77 
 
 
251 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.24 
 
 
249 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  33.89 
 
 
268 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  30.94 
 
 
281 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  35.22 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  33.49 
 
 
267 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  32.55 
 
 
248 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.18 
 
 
301 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  33.79 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  31.5 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  31.58 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  29.59 
 
 
350 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  30.71 
 
 
309 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  34.02 
 
 
248 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  31.42 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  29.54 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.31 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  30.86 
 
 
282 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  30.97 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  29.68 
 
 
286 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  35.58 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  29.97 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  32.13 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  32.24 
 
 
303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  32.23 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  29.46 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  31.91 
 
 
286 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  29.9 
 
 
321 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  31.98 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  31.51 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  29.54 
 
 
340 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  31 
 
 
293 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  30.04 
 
 
312 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  32.3 
 
 
234 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  30.45 
 
 
289 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  27.3 
 
 
308 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  29.77 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  32.33 
 
 
276 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  29.62 
 
 
312 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  31.65 
 
 
267 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  31.36 
 
 
254 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  31.51 
 
 
267 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  28.87 
 
 
261 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  31.65 
 
 
230 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  26.79 
 
 
305 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  30.13 
 
 
316 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>