271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4365 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  58.5 
 
 
254 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  57.32 
 
 
279 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  59.46 
 
 
261 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  57.14 
 
 
256 aa  168  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  46.58 
 
 
242 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  47.56 
 
 
249 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  44.52 
 
 
242 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  43.84 
 
 
247 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  46.58 
 
 
218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  43.24 
 
 
251 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  47.26 
 
 
243 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  45.21 
 
 
241 aa  121  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  47.65 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  48.32 
 
 
249 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  45.32 
 
 
254 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  40.4 
 
 
246 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  47.65 
 
 
249 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  39.6 
 
 
252 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  44.37 
 
 
271 aa  117  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  44.59 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  46.1 
 
 
242 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  39.04 
 
 
293 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  42.18 
 
 
245 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  42.18 
 
 
245 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  40.27 
 
 
244 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  46.1 
 
 
243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  42.57 
 
 
246 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  41.89 
 
 
244 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  36.3 
 
 
242 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  42.18 
 
 
244 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  39.77 
 
 
245 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  43.97 
 
 
240 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  45.07 
 
 
244 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  45.07 
 
 
244 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  45.07 
 
 
244 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  40.52 
 
 
256 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  37.16 
 
 
247 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  37.58 
 
 
244 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  41.55 
 
 
243 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  42.66 
 
 
281 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  35.62 
 
 
237 aa  104  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  40.94 
 
 
267 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  42.55 
 
 
246 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  40.46 
 
 
277 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  39.86 
 
 
282 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  43.08 
 
 
301 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  35.86 
 
 
261 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  37.04 
 
 
293 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  36.99 
 
 
251 aa  101  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 
268 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  33.56 
 
 
240 aa  101  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 
268 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  43.06 
 
 
241 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  38.26 
 
 
267 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  38.93 
 
 
265 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  41.13 
 
 
247 aa  97.1  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  39.58 
 
 
303 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  44.06 
 
 
242 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  39.86 
 
 
259 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  36.42 
 
 
267 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  38.78 
 
 
267 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  35.86 
 
 
308 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  42.97 
 
 
312 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  42.95 
 
 
254 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  38.73 
 
 
296 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  38.41 
 
 
249 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  37.5 
 
 
322 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  36.05 
 
 
267 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  38.78 
 
 
274 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  38.19 
 
 
336 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  38.1 
 
 
268 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  37.41 
 
 
264 aa  94.4  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  38.93 
 
 
295 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  33.14 
 
 
254 aa  94  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 
303 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  34.48 
 
 
244 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  38.51 
 
 
251 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  39.86 
 
 
305 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  36.73 
 
 
284 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  36 
 
 
243 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  37.09 
 
 
264 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.87 
 
 
249 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  43.75 
 
 
286 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  42.86 
 
 
281 aa  92.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  38.3 
 
 
241 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  40.62 
 
 
312 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  37.32 
 
 
264 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  36.55 
 
 
325 aa  91.3  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  33.77 
 
 
268 aa  90.9  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  32.75 
 
 
265 aa  90.5  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  36.55 
 
 
303 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  38.46 
 
 
340 aa  90.1  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  34.48 
 
 
308 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  37.93 
 
 
283 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  37.41 
 
 
267 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  35.86 
 
 
303 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>