279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4566 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  52.74 
 
 
296 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  52.5 
 
 
282 aa  275  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  48.8 
 
 
286 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  51.45 
 
 
313 aa  265  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  51.79 
 
 
281 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  46.42 
 
 
305 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  48.81 
 
 
321 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  49.13 
 
 
340 aa  260  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  47.1 
 
 
350 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  47.6 
 
 
305 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  50.55 
 
 
277 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  46.26 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  47.77 
 
 
301 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  46.92 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  43.54 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  45.39 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  43.75 
 
 
295 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  45.49 
 
 
312 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  45.58 
 
 
303 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  50.41 
 
 
293 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  45.24 
 
 
289 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  43.05 
 
 
303 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  44.03 
 
 
308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  43.69 
 
 
303 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  43.69 
 
 
303 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  45.27 
 
 
336 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  43.69 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  44.93 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  45.88 
 
 
288 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  42.62 
 
 
325 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  43.01 
 
 
254 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  38.23 
 
 
263 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  37.15 
 
 
272 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  39.78 
 
 
254 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  35.84 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  37.93 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  38.69 
 
 
259 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  37.15 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  43.33 
 
 
259 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 
268 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  35.15 
 
 
268 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  36.18 
 
 
264 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  37.46 
 
 
264 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  36.3 
 
 
316 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  36.43 
 
 
273 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  36.21 
 
 
282 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  34.95 
 
 
309 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  38.52 
 
 
279 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  35.27 
 
 
274 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  34.3 
 
 
261 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  35.4 
 
 
267 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  32.65 
 
 
267 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  35.52 
 
 
267 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  34.58 
 
 
268 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  40.91 
 
 
259 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  40.98 
 
 
269 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  37.82 
 
 
248 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  34.3 
 
 
252 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  38.71 
 
 
242 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  37.45 
 
 
265 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  38.87 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  36.26 
 
 
251 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  32.55 
 
 
267 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  35.16 
 
 
290 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  33.79 
 
 
268 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  36 
 
 
245 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  36 
 
 
245 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  38.15 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  35.82 
 
 
256 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  33.82 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  37.13 
 
 
249 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  38.15 
 
 
242 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  33.21 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.47 
 
 
247 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  35.04 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  32.85 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.69 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  35.32 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  32.97 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  36.26 
 
 
241 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  36.47 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  33.94 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  31.88 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  35.93 
 
 
247 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  34.43 
 
 
243 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  35.66 
 
 
240 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  36.8 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  37.13 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  36.1 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  33.7 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  33.88 
 
 
270 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  36.76 
 
 
249 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  36.03 
 
 
249 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  33.69 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  34.31 
 
 
251 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  118  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  31.16 
 
 
293 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  33.96 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  33.46 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>