299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3144 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  98.54 
 
 
203 aa  274  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  60.89 
 
 
256 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  52.67 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  52.5 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  51.69 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  51.49 
 
 
241 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  49.37 
 
 
276 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  50.21 
 
 
245 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  54.7 
 
 
256 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  51.71 
 
 
259 aa  221  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  53.48 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  51.58 
 
 
241 aa  188  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  42.31 
 
 
230 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  42.93 
 
 
221 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.68 
 
 
256 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  32.92 
 
 
251 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.29 
 
 
247 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  38.17 
 
 
241 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  37.04 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  37.04 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  33.47 
 
 
256 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  33.05 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  36.36 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.58 
 
 
246 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  32.92 
 
 
248 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.34 
 
 
237 aa  108  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  35.56 
 
 
288 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  32.1 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  34.17 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  35.39 
 
 
246 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  32.39 
 
 
303 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  35.04 
 
 
254 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.63 
 
 
252 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.72 
 
 
242 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  32.61 
 
 
313 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  29.91 
 
 
240 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  36.36 
 
 
242 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  30.29 
 
 
244 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  33.05 
 
 
242 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  31.46 
 
 
236 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  31.51 
 
 
336 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  34.16 
 
 
243 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  30.42 
 
 
244 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  31.4 
 
 
322 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  29.9 
 
 
303 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.05 
 
 
243 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  29.9 
 
 
303 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  32.01 
 
 
303 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  30.03 
 
 
308 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  35.37 
 
 
242 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  29.9 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  36.59 
 
 
247 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  43.06 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.65 
 
 
312 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.49 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.75 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  31.8 
 
 
249 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  31.44 
 
 
312 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.47 
 
 
240 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  29.63 
 
 
293 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  36.48 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.99 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  38.41 
 
 
166 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  32.99 
 
 
321 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  32.52 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  38.46 
 
 
284 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  32.52 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  42.36 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  31.72 
 
 
318 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  32.52 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  37.8 
 
 
293 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 
281 aa  95.1  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  33.62 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  41.67 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  36.9 
 
 
293 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  30.85 
 
 
340 aa  92.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.54 
 
 
243 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  30.77 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  30.54 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  29.1 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  32.86 
 
 
249 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 
308 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  27.87 
 
 
305 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  30.71 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  28.81 
 
 
305 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.78 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  30.28 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  30.1 
 
 
350 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  30.12 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  41.06 
 
 
290 aa  86.3  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  42.47 
 
 
292 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  41.89 
 
 
283 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  28.52 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  31.76 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>