281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2024 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  587  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  54.65 
 
 
284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  50.69 
 
 
293 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  49.31 
 
 
293 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  48.76 
 
 
284 aa  258  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  48.07 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  42.69 
 
 
284 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  40.77 
 
 
292 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  38.25 
 
 
289 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  40.91 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  36.75 
 
 
289 aa  188  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  38.14 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  37.54 
 
 
289 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  34.28 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  38.95 
 
 
288 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  38.73 
 
 
280 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  37.76 
 
 
287 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  37.33 
 
 
289 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  37.54 
 
 
289 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  33.67 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  37.2 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  34.05 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  36.14 
 
 
286 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  33.11 
 
 
313 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  35.2 
 
 
277 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  39.61 
 
 
270 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  34.52 
 
 
301 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  34.8 
 
 
272 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  39.22 
 
 
271 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  39.22 
 
 
271 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  33.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  39.22 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  33.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  33.1 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  34.15 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  37.71 
 
 
271 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  34.15 
 
 
272 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  32.34 
 
 
317 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  33.1 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  34.15 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  32.1 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  34.15 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  34.15 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  32.34 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  38.25 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  32.34 
 
 
317 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  37.89 
 
 
270 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  37.79 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  29.26 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  29.93 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  29.35 
 
 
316 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  34.53 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  33.45 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  32.5 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  28.19 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  31.21 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  32.56 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  28.92 
 
 
287 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  28.32 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.34 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  28.77 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  28.26 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 
286 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  30.9 
 
 
283 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  29.33 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  32.65 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  32.65 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  29.58 
 
 
308 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.46 
 
 
251 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  27.47 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.95 
 
 
242 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.73 
 
 
242 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  31.17 
 
 
243 aa  95.9  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  26.91 
 
 
252 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  29.01 
 
 
256 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  25.48 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.87 
 
 
244 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  38.71 
 
 
244 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  33.53 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  28.51 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  35.29 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  34.23 
 
 
237 aa  87  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  36.08 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.83 
 
 
243 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  41.06 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  36.13 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  36.62 
 
 
254 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  38.71 
 
 
246 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  28.62 
 
 
313 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  31.76 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  34.57 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  35.33 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.19 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>