249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0734 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  594  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  69.34 
 
 		 288 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  70.04 
 
 		 277 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  61.89 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  52.61 
 
 		 317 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  53.33 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  53 
 
 		 317 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  52.67 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  56.67 
 
 		 316 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  55.84 
 
 		 316 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  57.78 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  53.31 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  52.19 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  58.77 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  51.07 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  52.47 
 
 		 271 aa  268  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  51.07 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  51.07 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  47.86 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  49.29 
 
 		 272 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  47.86 
 
 		 272 aa  254  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  47.86 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  47.86 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  47.86 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  47.86 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  47.86 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  48.57 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  48.57 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  48.57 
 
 		 272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  48.57 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  48.57 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  47.5 
 
 		 272 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  46.43 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  48.57 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  43.6 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  44.17 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  44.37 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  44.37 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  47.5 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  44.21 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  46.01 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  43.01 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  46.79 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  41.81 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  43.78 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  44.06 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  40.71 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  41.67 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  37.41 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  41.67 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  41.32 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  38.85 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  38.35 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  35.66 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  36.75 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  36.49 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  36.97 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  36.27 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  36.1 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  35.21 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  35.45 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  35.61 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  36.04 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  34.98 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  33.1 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.69 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  27.11 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  27.21 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  23.66 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  23.91 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  24.83 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  24.54 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  35.47 
 
 		 221 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  35.47 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  26.18 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  36.76 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.01 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.03 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  36.07 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  35.97 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.98 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  27.62 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.78 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  36.45 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  25 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  30.41 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  29.35 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  25.86 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  22.26 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  29.61 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.91 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  31.91 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  31.91 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  36.36 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.45 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  32.24 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  34.65 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.09 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  35.05 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>