234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2036 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  99.63 
 
 
271 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  76.38 
 
 
271 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  68.27 
 
 
271 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  67.16 
 
 
270 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  65.68 
 
 
270 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  63.47 
 
 
270 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  62.73 
 
 
272 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  358  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  60.15 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  60.15 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  60.15 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  60.15 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  60.15 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  59.78 
 
 
272 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  59.78 
 
 
272 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  59.78 
 
 
272 aa  354  8.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  60.15 
 
 
272 aa  342  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  51.07 
 
 
289 aa  268  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  47.43 
 
 
288 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  47.27 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  46.91 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  46.91 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  48.12 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  46.82 
 
 
301 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  46.57 
 
 
317 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  44.81 
 
 
316 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  46.36 
 
 
298 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  44.81 
 
 
316 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  44.8 
 
 
313 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  46.07 
 
 
288 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  44.81 
 
 
317 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  44.64 
 
 
288 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  47.51 
 
 
284 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  43.51 
 
 
289 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  43.06 
 
 
280 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  40.43 
 
 
277 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  46.73 
 
 
245 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  41.99 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  40.71 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  40.36 
 
 
289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  42.59 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  40.35 
 
 
289 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  41.54 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  41.11 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  39.53 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  37.28 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  36.47 
 
 
283 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  35.79 
 
 
275 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  35.74 
 
 
275 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  37.54 
 
 
293 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  33.96 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  35.85 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  34.05 
 
 
287 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  36.49 
 
 
293 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  36.15 
 
 
284 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  32.96 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  39.22 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  35.32 
 
 
284 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  33.45 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  38.04 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.36 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  24.19 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.62 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  24.82 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  40.48 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  26.43 
 
 
308 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  27.14 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  37.4 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  23.7 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  36.72 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.29 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  27.57 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  37.4 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  25.38 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  35.56 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  38.28 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.21 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  38.98 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  30.64 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  37.6 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  34.06 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  43 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  31.25 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  32.43 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  32.43 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  31.33 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  31.33 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  32.68 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  34.88 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  36.43 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  30.16 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  30.46 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  34.29 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>