259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01596 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  84.12 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  69.34 
 
 
289 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  62.26 
 
 
301 aa  346  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  56.47 
 
 
317 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  56.12 
 
 
317 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  55.76 
 
 
317 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  55.04 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  54.15 
 
 
316 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  53.82 
 
 
316 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  55.15 
 
 
298 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  57.41 
 
 
317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  47.7 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  61.14 
 
 
245 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  49.81 
 
 
271 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  47.86 
 
 
272 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  47.86 
 
 
272 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  47.43 
 
 
271 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  47.43 
 
 
271 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  47.43 
 
 
271 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  47.5 
 
 
272 aa  254  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  47.5 
 
 
272 aa  254  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  47 
 
 
270 aa  251  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  45.23 
 
 
270 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  45.96 
 
 
284 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  49.01 
 
 
272 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  42.05 
 
 
280 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  47.88 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  43.71 
 
 
289 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  44.65 
 
 
289 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  43.48 
 
 
289 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  46.33 
 
 
270 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  43.43 
 
 
289 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  37.76 
 
 
300 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  43.43 
 
 
289 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  43.8 
 
 
289 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  43.43 
 
 
287 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  41.95 
 
 
277 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  43.32 
 
 
288 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  43.26 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  42.6 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  37.31 
 
 
287 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  39.35 
 
 
275 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  40.6 
 
 
276 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  38.97 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  37.97 
 
 
275 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  38.95 
 
 
286 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  37.98 
 
 
275 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  35.34 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  33.57 
 
 
292 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  34.28 
 
 
290 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  34.63 
 
 
293 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  33.92 
 
 
293 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  36.12 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  34.36 
 
 
284 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  33.59 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.02 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  27.82 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  27.51 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  26.97 
 
 
308 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  28.16 
 
 
291 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  24.41 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.73 
 
 
252 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  27.68 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.41 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  26.32 
 
 
246 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  23.05 
 
 
314 aa  89  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  36.07 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  31.94 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25.95 
 
 
242 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  32.08 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  31.51 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.07 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  31.21 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  26.74 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  28.88 
 
 
276 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  26.9 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  28.05 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  35.78 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  30.36 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  29.76 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  31.54 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  29.7 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  31.54 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  29.17 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  30.5 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  31.54 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  29.45 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  28.47 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  30.94 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  26.9 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>